国家863计划重大专项课题可行性论证报告提纲.docVIP

PAGE PAGE 12 国家863计划重大专项课题可行性论证报告提纲 课题名称： 生物芯片专项课题可行性论证报告提纲 概要：生物芯片是近年来在生命科学领域中迅速发展起来的一项高新技术， 它主要是指通过微加工技术和微电子技术在固格体芯片表面构建的微型生物化学分析系统，以实现对细胞、蛋白质、DNA 以及其他生物组分的准确、快速、大信息量的检测。常用的生物芯片分为三大类：即基因芯片、蛋白质芯片和芯片实验室。生物芯片的主要特点是高通量、微型化和自动化。芯片上集成的成千上万的密集排列的分子微阵列，能够在短时间内分析大量的生物分子，使人们快速准确地获取样品中的生物信息，效率是传统检测手段的成百上千倍。它将是继大规模集成电路之后的又一次具有深远意义的科学技术革命，为后基因组计划时期基因功能研究及现代医学科学及医学诊断学的发展提供强有力的工具，将会使新基因的发现、基因多态性研究、基因诊断、药物筛选、给药个体化等方面取得重大突破。本报告就国家863计划重大专项《生物芯片》课题的可行性作提纲性论证，在基因芯片和蛋白芯片的技术平台建立、关键技术研究及重大生物芯片产品应用研究等方面提出意见。 国内外研究开发现状与技术发展趋势，以及知识产权状况 生物芯片 (Biochip) 技术是九十年代发展起来的一项新技术，它采用平面光导原位合成或微量点样等方法，将大量生物分子如核酸片段，多肽分子甚至组织切片、细胞等生物样品有序地固化于支持物（如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体）的表面，组成密集的分子排列，然后与标记的待测生物样品中的靶分子反应，通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描仪或电荷偶联摄影像机（CCD）对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析，从而判断样品中靶分子的数量。根据芯片上的固定的探针不同，生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片，另外根据原理还有元件型微阵列芯片、通道型微阵列芯片、生物传感芯片等新型生物芯片。 为了叙述的方便，我们将生物芯片分为基因芯片、蛋白芯片与芯片实验室。 1、基因芯片 国内外发展趋势和现状：基因芯片是生物芯片中最基础的，也是研究开发最早、最为成熟和目前应用最广泛的产品。现在，基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达谱检测，寻找新基因，杂交测序，基因突变和多态性分析以及基因文库作图以及等方面。 基因表达谱芯片又分为cDNA芯片和寡核苷酸芯片两种，前者芯片探针为cDNA，后者探针为寡核苷酸片段。在疾病诊断、新药筛选及科学研究方面具有独特的优势。基因突变和多态性分析多采用寡核苷酸芯片芯片，常用于病原微生物的分型与耐药基因突变的检测，以及HLA基因分型。 国内外目前主要采用cDNA芯片进行基因表达的检测，芯片制备所用的DNA探针一般为已知基因cDNA克隆的PCR扩增产物或EST的扩增产物。芯片上的点数从几百到几万不等，片段长度从几百bp到几个Kb不等。主要用于1、 基因的功能研究；2、疾病相关基因研究与疾病诊断；3、药物作用机理、毒理研究与新药筛选。迄今为止，关于病毒、细菌、真菌（尤其是全基因序列已知的酵母菌）、植物、哺乳动物及人的大部分组织或细胞的基因表达谱等都有过用芯片研究的报道。国外也有少量用寡核苷酸芯片进行基因表达谱研究的报道，主要用于基因功能研究、新基因发现等方面。由于基因中存在短的重复序列，cDNA芯片在检测的特异性方面具有潜在的缺陷，此外，进行cDNA芯片的研制需要较多的投资。 无论是寡核苷酸芯片还是cDNA芯片，都是测定大规模基因表达谱的强有力工具。从方法学角度来看表达谱芯片正朝着以下几方面发展：一是提高探针阵列的集成度，如有多家公司的芯片阵列的集成度已达一万个以上，这样基因数量在数万个以上的生物体的基因表达情况只用一块芯片即可包括。二是提高检测的灵敏度，如检测系统的优化组合和采用高灵敏度的荧光标志。三是提高检测的真实性、准确度和稳定性，避免假阳性和假阴性。四是方法的标准化和降低成本，简化制备方法，加快研制速度。 基于基因突变和多态性分析的病原微生物的分型与耐药基因突变检测、以及HLA基因分型芯片是寡核苷酸芯片的另一主要应用方面。由于各个国家的情况有一定的差异，各国的侧重点有一定的差别。在这一方面投入较多的反而是亚洲国家。目前，大家在这一方面基本处于同一阶段，尚没有商品化的产品。 国内现有技术基础 国内近两年已有多家研究单位开展了生物芯片的研究工作，如军事医学科学院，清华大学，上海联合基因集团，深圳益生堂等单位，已有一大批相关的研究成果，有几家公司已能生产和销售用于生物芯片研究的仪器设备以及相关产品。益生堂生物企业有限公司早在1999年就与军事医学科学院合作