第十二章转座子.pptVIP

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第十二章 转座子 麦克林托克--转座子的发现 第一节 转座子种类与鉴别 二、转座子鉴别 突变基因位点的确定 amam(花斑) A2A2C1C1C2C2 ×a1a1A2A2C1C1C2C2 (测验种,无色) 自主和非自主转座子的鉴别 a1a1(花斑) A2A2C1C1C2C2 ×A1A1A2A2C1C1C2C2 非自主转座子的鉴别 Ac a1a1(花斑) A2A2C1C1C2C2 × ac A1A1A2A2C1C1C2C2 第二节 重要玉米转座子系统 二、AC-DS系统 三、SPm系统 第三节 转座发生的时间与控制因子突变的性质 一、转座发生的时间 二、控制因子突变的性质(略) 第四节 转座因子的分子基础 Ac中编码转座酶的长度为2421bp的ORF。有证据表明,转座酶的结合序列为目标DNA上的AAACGGG,并且需要该序列6次以上的重复才能稳定结合(Becker和Kunze, 1997)。甲基化对上述结合有很大影响,两条链上的C被甲基化后,则不能结合,只有一条链甲基化则显著影响结合。因此,甲基化可能在转座过程中发挥重要作用。 正常结合: AAACGGG TTTGCCC 结合弱化: AAA mCGGG TTT GCCC 有一系列的Ds因子,都能够引起结构基因插入突变并对Ac因子发生反应。但有可靠证据表明,并非所有Ds因子都能引起染色体断裂。只有一种称作“双重Ds”(double Ds)的类型才有使染色体断裂的能力(H. P. D?ring,1986)。这种双重Ds因子由两个只有2041bp的Ds拷贝组成,其中一个拷贝以反向方式插入另一个拷贝分子中,它的末端反向DNA序列重复4次,其他部分也以反向方式重复两次,其转座所致染色体断裂过程如图12-5。 SPm系统 控制因子利用其特定的靶子位点重复(target site duplication,TSD)DNA与受体基因相连接,插入基因座位。在它们离开插入位点时,TSD与转座因子一起消失。但在植物中,转座因子离开之后,TSD常常被遗留下来形成印迹(footprint),不过这种遗留下来的TSD,有时与原来的TSD有所不同,个别碱基可能被替代或丢失(图12-18,图12-19)。如果转座因子的插入和跳出,发生在内含子或基因前导序列(leader sequence),其后果很难觉察得到。如果发生在外显子,在遗留的TSD碱基不是3的倍数时,有可能产生移码突变(frameshift mutation),是3的倍数时,TSD碱基有可能增加少数氨基酸,使回复突变的蛋白质与原始类型有所不同 与Ac类似,Spm的活性也受甲基化影响,甲基化抑制其转座能力。但具体的调控方式还不完全清楚。Fedoroff(1995)认为,Spm 5’端至转录起始点的上游控制区域(UCR)甲基化与其失活有关。Spm编码产生的两个蛋白TNPA和TNPD是转座所必需的,两个蛋白通过与Spm端部结合,促使Spm与DNA的紧密结合。TNPA结合于Spm靠近端部的重复区域,可以使Spm启动子脱甲基化。同时,通过影响转录和转座实现Spm的调控。图12-17为Spm的分子调控模式。 控制因子利用其特定的靶子位点重复(target site duplication,TSD)DNA与受体基因相连接,插入基因座位。在它们离开插入位点时,TSD与转座因子一起消失。但在植物中,转座因子离开之后,TSD常常被遗留下来形成印迹(footprint),不过这种遗留下来的TSD,有时与原来的TSD有所不同,个别碱基可能被替代或丢失(图12-18,图12-19)。如果转座因子的插入和跳出,发生在内含子或基因前导序列(leader sequence),其后果很难觉察得到。如果发生在外显子,在遗留的TSD碱基不是3的倍数时,有可能产生移码突变(frameshift mutation),是3的倍数时,TSD碱基有可能增加少数氨基酸,使回复突变的蛋白质与原始类型有所不同。 二、诱发与活化 Spm因子(从wx-84-4得到)和I因子(从wx-m8得到)分子的基本结构与Ac和Ds因子很相似。它们分子的两端有一个由13个碱基对组成的反向重复序列TIR(CACTACAAGAAAA)。紧挨着TIR,是由以12个碱基对为基本单位(CCGACACTCTTA),以顺向或反向重复若干次,形成的各由大约200个碱基对组成的“柄”(stem),柄中间是它们的功能单位。Spm因子由8248bp组成,I因子由2.2kb组成。它们之间的6.2kb的差异导致了I因子转座能力的丧失。Spm因子在883

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