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重组DNA技术是在分子水平对基因进行体外操作,因而也称为分子克隆(molecular cloning)或基因克隆。
所谓克隆(clone):是指通过无性繁殖过程所产生的与亲代完全相同的子代群体。;分子克隆:是在体外对DNA分子按照既定的目的和方案进行人工重组,将重组分子导入到合适的受体细胞中,使其在细胞中扩增和繁殖,以获得DNA分子大量复制,并使受体细胞获得新得遗传特征的过程;基因工程最基本的必备的材料:
工具酶
载体
目的基因
原核或真核宿主细胞
;分子克隆的基本过程:
分:得到目???基因
切:将目的基因和载体用适当的限制性内切酶切割
接:将目的基因和载体连接,形成重组子
转:将重组子转到适当的宿主细胞中
筛:筛选出含正确重组子的宿主细胞,扩增;第一节?? 基因工程中常用工具酶;工具酶分类
使核酸降解的核酸酶类:核酸内切酶、核酸外切酶
催化核酸合成的酶类:DNA聚合酶,RNA聚合酶,连接酶,逆转录酶
核酸修饰酶类:甲基化酶,激酶,基团转移酶, 磷酸酶等;一、 限制性核酸内切酶;限制性核酸内切酶(restriction endonuclease,RE)
是由细菌自己产生的一种能识别双链DNA中的特定序列,并以内切方式水解核酸中磷酸二酯键的核酸内切酶。;1.限制性核酸内切酶的分类:;Ⅲ型RE;由两种亚基组成。需Mg++,ATP为辅助因子;切割位点靠近识别序列但较难预测。一般在25~27bp范围内切割。现已报道4种。
I、Ⅲ型RE酶同时具有限制(剪切)与修饰(甲基化)两种功能并依赖于ATP,切割DNA链的位置远离识别序列,因此I型和Ⅲ型酶在DNA重组技术中都不常用。;Ⅱ型RE实际应用价值最大,这是因为:
①Ⅱ型酶只具有限制性活性,无甲基化修饰活性;
② 对DNA的切割要求严格的序列作为靶位点,切割精确;
③ 此类酶作用时只需Mg2+参与,无需ATP。
因此Ⅱ型限制性核酸内切酶是基因工程中剪切DNA分子的常用工具酶,被誉为“分子生物学家的手术刀”。;2.限制性内切酶的命名
目前已广泛采用Smith和Nathams于1973年提出的命名系统:
限制性内切酶第1个大写字母:来自细菌的属名(genus),
第2、3个小写字母:来自种名(species),
第四个字母代表菌株(strain);3.Ⅱ型限制性内切酶的作用特点:
被分子生物学家广泛研究应用,现已发现有200多种识别序列的RE
MW=60KD的单链多肽
最适pH:6~8
NaCl有抑制作用,Mg2+ 激活,巯基有保护作用
热不稳定。;作用特点:
有严格的识别、切割的DNA序列,并以内切的方式水解双链DNA中的磷酸二酯键。
识别序列一般为4~6个碱基对。
切割靶序列的大小决定了切割DNA链后产生的DNA片段的长短
切割后产生平头或粘性末端。
只需Mg2+,不需ATP。;4. Ⅱ型酶切割dsDNA可产生两种不同的切口
1. 平头末端(blunt end) 即在识别序列的对称轴上进行切割;
2. 粘性末端(cohesive end) 即在识别序列的两个对称点切开DNA双链,产生末端带有单链尾巴的切口。根据突出端不同分为:5’粘性末端和3’粘性末端。;Ⅱ型酶切割dsDNA产生的两种不同的切口;5. 三类特殊性质的Ⅱ型限制性内切酶:
同裂酶(isoschizomer):又称源同异工酶,即识别位点相同,但切割位点可以相同,也可以不同,例如Sam I(CCC↓GGG)和Xma I(C↓CCGGG) ;
Sau3A I BamH I
GATC GGATCC
CTAG CCTAGG
SauI Xho I
GTCGAC CTCGAG
CAGCTG GAGCTC;可变酶:此种酶所识别DNA序列中的一个或几个碱基是可变的,并且识别序列往往超过6个碱基对,例如Bstp I识别序列为:GGTNACC,其中N为一可变碱基。;6. RE识别序列呈反向对称,分为四种类型;简并序列(degenerate sequence)又称“松弛”特异识别,即识别位点中某些核苷酸可以被其他核苷酸替换。 ↓
如:AvaⅡ:5’—G GA/TCC—3’
3’—CCT/AG G—5’
↑
非回文结构:
↓
如:MboⅡ:5’—GAAGAN —3’
3’—CTTCTN —5’
↑;7.限制性内切酶的应用;8. RE使用时的注意事项;二、DNA聚合酶 DNA polymerase;1.DNA聚合
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