细菌的分类和命名讲义.pptVIP

细菌的分类和命名;序：进化的概念： 两种分类原则： 第一节 进化的测量指征 一，进化指征的选择 二，rRNA作为进化指征 16SrRNA 特点;;*;全生命系统树－－ (Olsen Woese 1993) 三，三界生物的主要特征;微生物分类学;一，分类单元及等级 界 Kingdom 原核生物界 门 phylum 细菌门 纲 class 真细菌纲 目 order 放线菌目 科 family 分支杆菌科 属 genus 分支杆菌属 种 species 结核分支杆菌;种的概念;微生物的学名;双名法;双名法的实例;三名法;有关学名的其他知识;有关学名的其他知识;有关学名的其他知识;亚种以下的几个分类名词;菌型：曾用作菌株的同义词，现已废除，仅作若干变异型的后缀 菌群：两种微生物介于他们之间的一些过渡类型的菌种，具有某些共同性状。 如：大肠菌群包括大肠杆菌、产气肠细菌及他们之间的过渡类型;菌株（品系）;分类依据: 一、形态特征（个体和群体）细胞形态：形状、大小、排列、染色反应等。培养：固体— 菌落，半固体— 穿刺，液体。 二、生理生化反应营养要求：碳源、氮源、营养类型代谢产物：种类、产量、显色反应酶：产酶种类、反应特性;三、其他 血清学反应 血清学试验与噬菌体分型 近年又发展了红外光谱，gc含量，dna杂交等。 生态学特征相互关系、宿主种类、与氧关系等。  四、氨基酸和蛋白质分析;五、核酸的碱基组成和分子杂交; 每个生物种都有特定的GC%范围，因此 可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25--75%，变化范围最大，因此更适合于细菌的分类鉴定。; GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，; 同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下；同属不同种的差别应低于10～15%； ;2. 核酸的分子杂交;DNA杂交法：;1）DNA-DNA杂交；; 第四节 微生物的快速鉴定和 自动化分析技术;1、 API 细菌数值鉴定系统 2、 Enterotube 系统 3、 Biolog 全自动或手动细菌鉴定系统 ;1、 API 细菌数值鉴定系统;API—细菌鉴定系统 ;2、Enterotube 系统;3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 ;（一）经典分类法; 是通过广泛比较分类单位的性状特征，然后计算它们的相似性，再根据相似性的数值划分类群的一种分类方法。 至少50－60个性状以上 同等重要 只能划分到类群;方法步骤 根据较多特征分类，每一特征地位相同。1、每一菌株为一操作单位，确定很多特征（50—60 个） 2、比较菌株间的最大相似性阳性和阴性符合的总和---------------------------------× 100%总的测定数 --- 无效测定数85%为同种，65%为同属 3、据数值绘出矩阵图并转换成树状谱。;;（三）分子与遗传方法;3、16s rRNA寡核苷酸编目分析 水解rRNA产生一系列寡核苷酸片段，顺序分析。近年来，采用红外、核磁、电镜等新技术越来越广泛。;四、分类系统;《伯杰氏系统细菌学手册》第2版， 分为5卷 古生菌域 泉古生菌门 广古生菌门 2门8纲－－－208个种 细菌域 23门31纲－－4727个种 （沈萍） （周德庆） ;最新资料（沈萍第四版微生物学实验）;真菌：ainsworth (1983)系统 粘菌门 菌物界 鞭毛菌亚门 接合菌亚门 真菌门 子囊菌亚门 担子菌亚门 半知菌亚门;第八版 1995年;酵母：lodder分类系统 菌种鉴定工作三部曲1、获得该微生物的纯培养2、测定一系列必要的鉴定指标3、查找权威性鉴定手册