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中国猪链球菌PFGE型别 SmaI酶切：ST7型分为单一的PFGE-01型 2005，2006年和2007年中国ST7菌株：PFGE-01型 Ye, et al. 2006. Emerg.Infect.Dis. * code Locus§ Location in GZ1 Matches In GZ1 % Tandem repeat sequence Tm℃ Simpson’s index %? TR1 SSTR135_111bp_445_3u 135784..136228 64 CGTTAAGCAAATCCTAGACAAAATAGGAAATCGAAGCAGATAGCTTCAATCAAGGAGATTTATCTTTTTGCCAGAATTTGTAGCTCGAATTCAACTAAGATTAAGATAGAGGA 60 4.7 TR2 SSTR218_39bp_210_2.7u 218682..218891 94 AGCAGCCTGTAGTTGAGGCACCTGTAGAGGAAGTTGTAG 58 8.2 TR3 SSTR1675_102bp_287_2u 1675611..1675897 88 CAAGAAAAAATGGTCCATTCTCGCCGTTGCGCCTTTCCAGTTTCTTGGGCG 60 5.9 TR4 SSTR1260_90bp_928_7u 1259913.. 260840 84 ATATTGAAACCTCTGAAAAACAGATGCCAAGTATTGTGAACGACAATGTCGTAACACCTGAAAAGCAAATGGCTAATAAAGAGAACGATA 55 8.3 TR5 SSTR69_49bp_352_2u 69283..69634 89 AAGGTCCGGTGGACCTTTTTATCATGAGCATGAAAACAAGAAAGCGAATT 60 5.9 TR6 SSTR928_30bp_172_2u 927971..928142 100 CGTTGCTGGTACCGTAGCAGTTGCATCAGT 60 7.0 TR7 SSTR127_10bp_134_4u 127866..127999 96 AAAATATAGA 58 7.1 TR8 SSTR260_231bp_677_2u 260573..261249 80 CCAGAAGAGCCAAAACAAGACGCTCCACAAGCGCCATCAACACCGGAAAAACAAACAGAAGAACCGAACAAGGAAGAACCTAAGAAAACACCACAAGCGCCATCGACTCCGGAAAAACAACCAGAAGTACCGGAATCACCAAACCCAGAGACACCAGACGCGCCATCGACTCCAAAAGATGAACCGCAAGCTCCATCAATCCCAGAAGAAAAACCAAAAGTA 55 22.7 TR9 SSTR709_5bp_354_38u 709802..710155 100 GAGCA 58 96.1 猪链球菌MLVA指标和特征 上游引物标记： FAM / HEX/ TAMRA. 多重PCRs M1和M2用毛细管电泳 M3用普通电泳法 TR1~8 低或中等变异度指标 TR9 高变异度指标 (value 0.96). * 指标的等位基因型 * 166 株 猪链球菌血清2型 的MLVA分型 * * * 2005年江西猪链疫情的分析 冷库的搬运工： JX1 冷库猪肉： Jxs1，Jxs2 ，Jxs3 共同的型别MLVA31. 江西病猪来源于江苏 1998年的三株江苏菌株和2005年的江苏菌株也为MLVA31型。 * 输入性人感染猪链球菌分析 2009年4月， 泰国籍。 我们实验室鉴定，分离菌株（W2886） 血清2型， ST1型。 TR1 TR2 TR3 TR4 TR5 TR6 TR7 TR8 TR9 W2886 3 0.4 2 7 2 1 4 2 23 GZ1 3 2.7 2 7 2 2 4 2 38 SC06134 3 0.4 2 7 2 2 4 2 26 07GZ2 3 0.4 2 7 2 2 4 2 36 SC84 3 2.7 2 7 2 2 4 1 30 * Cluster I Cluster II 猪链球菌 血清二型 种群关系 * 中国流行株型别特征 流行株： B组 MLST－7 PFGE-SmaI 01 在中国，ST1型属于散发菌株 MRP+ SLY+ EF- MRP+ SLY+ EF+ MRP+ SLY+ EF+ MRP- SLY- EF- * 分型可以判定强毒株和弱毒株 Cluster I cluster II MLST ST1 序列群 ST25 病症 侵袭性病症 肺、上呼吸
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