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第四章
氨基酸、肽和蛋白质;主要内容;——蛋白质的构件分子;实验证据;构成蛋白质的AA只有20余种,且都是α-氨基酸。
除甘氨酸外,19种AA都具有旋光性。
除胱氨酸和酪氨酸外,其余AA都能溶于水。;按R基的化学结构分类:;二、氨基酸的酸碱性质;H3N—CH—COOH;;(三)氨基酸的等电点;Ka1*Ka2=……;甘氨酸滴定曲线;pI 取决于两性离子(兼性离子)两边pK’值的算术平均值
酸性AA:pI = (pK’1 + pK’R-COO- )/2
碱性AA:pI = (pK’2 + pK’R-NH2 )/2 ;;;(四)氨基酸的甲醛滴定;
NH2 OH
R CH COOH + HNO2 R CH COOH+H2O+N2
Van Slyke 法测氨基氮(体积)的基础,N2中的1/2为氨基氮。
;最经典、最易进行的亲核取代反应之一
丹磺酰氯:用于多肽N末端氨基酸的标记和微量氨基酸的定量测定!;NO2;—N=C=S + N—CH—COOH;
R’ COOH R’ COO
C=O + H2N CH C=N CH
H R H R;
在生物体内经AA氧化酶催化
即脱去α-氨基而转变为酮酸。;(2)成酯 NH2 干燥,HCl R CH COOH + C2H5OH 回流 R CH COOC2H5 + H2O;
HN-保护基
R— CH-COOH + PCl5
HN-保护基
R — CH-COCl + POCl3 + HCl;
NH2 脱羧酶
R—CH-COOH
R-CH2-NH2 +CO2
;
YNH O NH2NH2
R—CH—C—OCH3
YNH O HNO2
R—CH—C—NHNH2
YNH O R—CH—C—N -—N+ N + 2H2O ;(三)羧基和氨基都参加的反应;2、与茚三酮的反应及其应用;Tyr酚基在3和5位上易发生亲电取代反应,
如碘化和硝化;Tyr与重氮苯磺酸生成橘黄色化合物,用于检测酪氨酸;精氨酸Arg侧链胍基与环己二酮生成缩合物;色氨酸Trp侧链吲哚基能被N-溴代琥珀酰亚胺氧化
——分光光度法测定Trp含量;甲硫氨酸Met侧链上甲硫基:强亲核基团与烃化试剂成锍盐;半胱氨酸Cys的巯基不稳定,易被氧化成二硫键,二硫键可被氧化剂(过甲酸)以及还原剂(巯基化合物)打开。;与二硫硝基苯甲酸发生硫醇-二硫化物交换;四、AA构型和光谱性质;(二)氨基酸的光谱性质;可见光区:无吸收
远紫外和红外区:都吸收
近紫外区(200—400nm):酪氨酸Tyr/色氨酸Trp/苯丙氨酸Phe
原因:芳香族氨基酸
不饱和体系;Trp 280nm
Tyr 275nm
Phe 257nm;(一)肽和肽键的结构;①肽键中C-N键有部分
双键性质
——不能自由旋转
②组成肽键原子处于
同一平面(肽平面)
③键长及键角一定
④大多数情况以反式
结构存在;;共价主链 ;(二)肽的物理化学性质;肽的化学性质;1 谷胱甘肽(γ-谷氨酰-半胱氨酰-甘氨酸);;2 血管紧张肽Ⅱ ;3 催产素 ;1838年,J. J. Berzelius提出,由proteios衍生而来 ——第一重要、首要的物质;一、蛋白质通论;2、蛋白质的含氮量;3、蛋白质的分类;(二)蛋白质的大小与分子量;蛋白质与多肽无严
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