质谱技术在DNA甲基化研究中的应用.pdfVIP

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2019-10-14 发布于湖北
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生物技术通报 · 技术与方法 · BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2015 ， 31(11)：112—120 质谱技术在 DNA 甲基化研究中的应用黄新凤叶金波刘建军 (深圳市疾病预防控制中心现代毒理学重点实验室，深圳 518055) 摘要： DNA甲基化是最重要的表观遗传修饰之一，主要发生在哺乳动物基因组CpG核苷酸序列中的胞嘧啶 c．5位点，并与机体生长发育、转座子沉默、x染色体失活及许多疾病的发生相关。但对DNA甲基化的形成、维持和重构的分子机制的认识是有限的，需要从基因组水平寻找最优的DNA甲基化定性和定量分析方法，而质谱技术以高敏感性、高通量、高准确率、高分辨率、快速且重复性好等优势在该研究领域具有较大的应用价值。介绍质谱技术在全基因组DNA甲基化和启动子区甲基化分析中的应用。关键词：全基因组DNA甲基化；启动子区甲基化；质谱；液相色谱 DOI：10．13560／j．cnki．biotech．bul1．1985．2015．11．012 ApplicationofM assSpectrometricTechnologyin DNA M ethylationStudy HuangXinfeng YeJinbo LiuJianjun (KeyLaboratoryofModernToxicologyofShenzhen，ShenzhenCenterforDiseaseControlandPrevention，Shenzhen518055) Abstract： DNAmethylationisoneofmostimportantepigeneticmodifications，whichmainlyoccursincarbon一5positionofCpG nucleotidesequenceinmammalgenomesandrelatestoorganism development，transposablesilence，Xchromosomeinactivationandmany diseases．Theunderstandingformolecularmechanism ofDNA methylationformation，maintenanceandreconstructionremainlimited ． however，inordertofindanoptimalmethodforDNAmethylationqualitativeandqunatitativenaalysis，massspectrometrictechnologywithhigh sensitivity，goodperformance，highprecision，highresolutionandgoodrepeatability，hasagreatvalueinthestudyofDNA methylation ． Inthe following，wewillmakeaintroductionofmassspectrometrictechnologyapplication inwholegenomicDNA methylationandpromoterDNA methylation