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实验十三谱系聚类
实验目的和要求
掌握谱系聚类分析的理论与方法、模型的建立;掌握利用谱系聚类分析的SAS 过程解决有关实际问题.
实验要求：编写程序，结果分析.
实验内容：
要求：
1.写出谱系聚类步骤，类间距离公式；
谱系聚类法的步骤：
1） n个样品开始时作为n个类，计算两两之间的距离，构成一个对称距离矩阵
o d\2 ??- dln
d°[ 0 …d°
D（o）= 此时 D（p,g） = d卩勺
? ?? ??? ??? ???
dn\ dn2 …dnn
2） 选择D（o）中主对角线以下（或以上）最小元素，设为d,,q，这时Gp={xp}与 Gq={xg}^Gp与Gq合并为新类Gr二{Gp,G」?在￡＞（（））屮消去G”与Gq对应的行与列, 加入新类与剩下未聚合的类间距离所组成的一行和一列，得新的-1阶距离矩阵D⑴?
3） 重复步骤（2）,得D⑴T D⑵T…一几一），n个样品聚为一个大类.
4） 记下合并样品的编号及两类合并时的距离（称为距离水平），绘制聚类谱系图.
类间距离及其递推公式：
类G“与G“间距离Dl）q. G“和q合并得G「类间距离入、类间距离递推公式有4 种：
1） 最短距离、递推公式
% = min^. p e Gp,j g Gq\——两类中样品Z间距离最短者作为类间距离
Drk = minp” i e G,, j w G」二 mm[Dpk,Dqk}递推公式
2） 最长距离、递推公式
=max{d“ i e GpJ e Gq\ 两类中样品之间距离最长者
D,,max{D
D,,
max{D冰，DqJ = max|J..
3）类平均距离、递推公式
丄 E E血—两类小所有两两样品之间的距离的平均
◎ — iwGpjwGq
1 y\ /7
山赢熹?;%+严递推公式 类平方距离
y ——两类中所冇两两样品z间的平方距离
nPn.叫耳
1 n
递推公式Df御弋兀
4）重心距离、递推公式
。凶=〃（爲，爲）——两类的重心Z间的距离作为两类间的距离 吩絆+沙-说氐递推公式
2.书上6.9
(1)
程序如下：
data examp6_9;
input blmc $ xl-xl4;
cards;
xl 1?000 0? 366 0? 242 0?280 0?360 0?282 0?245 0.448 0?486 0?648 0? 679 0?486 0? 133
0.376
x2 0? 366 1?000 0? 233 0? 194 0.324 0?263 0?265 0.345 0?367 0? 662 0?681 0? 636 0? 153
0.252
x3 0? 242 0? 233 1?000 0? 590 0?476 0?483 0? 540 0?452 0?365 0?216 0? 243 0? 174 0.732
0.676
x4 0? 280 0? 194 0? 590 1?000 0?435 0?470 0?478 0.404 0?357 0? 316 0? 313 0? 243 0?477
0.581
x5 0.360 0.324 0?476 0.435 1.000 0.452 0.535 0.431 0.429 0.429 0.430 0.375 0.339
0.441
x6 0? 282 0? 263 0?483 0?470 0?452 1?000 0?663 0? 322 0?283 0?283 0? 302 0? 290 0.393
0.447 x7 0.245 0.265 0.540 0.478 0.535 0.663 1.000 0.266 0.287 0.263 0.294 0.255 0.446 0.440 x8 0.448 0.345 0.452 0.404 0.431 0.322 0.266 1.000 0.820 0.527 0.520 0.403 0.266
0.424
x9 0.486 0.367 0.365 0.357 0.429 0.283 0.287 0.820 1.000 0.547 0.558 0.417 0.241 0.372
X10 0?648 0?662 0?216 0?316 0?429 0?283 0?263 0.527 0?547 000 0?957 0?857 0?054
0.363
xll 0?679 0? 681 0? 243 0? 313 0.430 0? 302 0?294 0? 520 0? 558 0?957 1?000 0?852 0?099
0.376
X12 0.486 0? 636 0? 174 0? 243 0? 375 0? 290 0? 255 0.403 0?4：17 0? 857 0? 852 1?000 0? 055
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