基因组学第9章.pptVIP

蛋白质组 1) 蛋白质翻译 2) 蛋白质加工 3) 蛋白质修饰 4) 蛋白质折叠 5) 蛋白质降解 真核生物蛋白质合成 mRNA翻译调控 两种调控水平: 1) 整体调控: 主要集中在翻译起始 2) 专一性调控: 针对不同的蛋白质合成 翻译起始--真核生物(1) 翻译起始-真核生物(2) 翻译起始—Kozak顺序（3） Kozak顺序: ---ACCAUGC--. 翻译起始的Kozak顺序 不同生物翻译起始顺序比较 古细菌的翻译类似真核生物 在许多方面，古细菌翻译更多地类似真核生物而非细菌, 不同之处是，古细菌的70S核糖体、23S、16S和5S rRNA 与真细菌类似。古细菌的翻译方式十分奇特，其rRNA的 碱基配对二级结构与真细菌显著不同，也有别于真核生 物rRNA，但古细菌与rRNA结合的蛋白质却类似真核生 物。古细菌mRNA的5‘-端加帽，3’-端具多聚腺苷酸，翻 译起始与真核生物类似，涉及扫描过程。古细菌的tRNA 有些独特的个性，如三叶草的TψC臂中缺少胸腺嘧啶， 并在不同的位置有些核苷酸发生在真细菌与真核生物中 未见过的修饰。古细菌由翻译起始tRNA携带的甲硫氨酸 并非N-甲基甲硫氨酸，但翻译和延伸因子与真核生物类 似。 专一性翻译起始调控 发夹结构的调控机理 1) 发夹结构由翻译起始复合物eIF4A解除 2) 解除发夹结构需要能量. IRES顺序 1) IRES: internal ribosome entry site 2) IRES的作用: 核糖体可以IRES直接结合起始翻译, 无需扫描. 适合无帽结构mRNA, 多顺反子的内部起始翻译. 3) 例子: 无加帽的细胞自身的mRNA和病毒的无加帽mRNA; SV40重叠基因的mRNA内部翻译起始. 程序性移码 专一性翻译起始调控 蛋白质的加工与修饰 蛋白质加工: 1) 引导肽或导肽的切除. 2) 将多肽链可变剪切产生顺序重叠功能各异 蛋白质. 3) 切除蛋白质内部顺序, 连接两侧顺序. 蛋白质修饰: 将蛋白质中的氨基酸进行修饰, 添加不同的化学基团. 进入叶绿体或线粒体的蛋白质引导肽的切除 细胞质中合成的线粒体蛋白质含有前序列(presequence), 类似叶绿体蛋白质的靶向导肽, 进入线粒体时被切除. 线粒体蛋白质信号顺序切除 哺乳动物阿黑皮质素在不同细胞中的切割产生不同的多肽激素 内切肽(Intein) 1) 所谓内切肽是指翻译产生的多肽序列中被切除的内部多肽顺序. 2) 含有内切肽的蛋白质必需将内切肽切除才能成为成熟的蛋白质. 3) 目前已在古细菌,真细菌和真核生物中发现130多种具内切肽的蛋白质. 4) 内切肽的切除机制基本相同. 内切肽的切除过程 内切肽有保守的顺序组成 蛋白质剪接(内切肽切除)的分子机制 蛋白质反式剪接 蛋白质氨基酸侧链的修饰 添加的基团 修饰的残基(s) 可逆性 Phosphoryl tyr, ser,thr, his yes Methyl lys yes Acetyl lys, N-terinus yes(lys) Hydroxyl pro, lys no Carboxyl glu no Sugars ser, thr, hydroxypro,asn no Myristyl cys, his no Glycoophospholipid C-terminus no Prenyl cys no ADP-ribose ?