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中国生物工程学会2012年学术年会暨全国生物技术大会论文摘要关。因此,本文研究miR-200家族对AP-2r,基因的调控,以及与子宫内膜癌细胞对顺铂敏感性的关系。
中国生物工程学会2012年学术年会暨全国生物技术大会论文摘要
关。因此,本文研究miR-200家族对AP-2r,基因的调控,以及与子宫内膜癌细胞对顺铂敏感性的关系。 本文通过生物信息学分析,发现AP-2a基因的3’端非翻译区(uTR)有一个miR-200家族共有的结合位点,而
且在这个结合位点上有一个单核苷酸多态性(SNP)位点rsl045385。荧光素酶报告基因分析表明:miR-200家族的 三个成员都能结合到AP-2et基因3’uTR上。在AP-20t高表达的宫颈癌细胞系HeLa中过表达miR-200b、miR-200c 和miR-429中的任一个都能够抑制AP-2a蛋白的表达;而在miR-200表达高的子宫内膜癌细胞系HEC—l—A细胞中 抑制miR-200b、miR-200c和miR-.429中的任一个miRNA的表达都能增强AP-2a的表达。这些结果说明miR一 200b、miR-200c和miR-429都能负调控细胞内源性的AP-2a的表达。
为了研究SNP位点rsl045385的多态性对miRNA结合的影响,我们将含有不同等位型SNP位点(A或c)的3’ LrrR分别克隆到荧光素酶报告基因载体pmirGLO中,并且与miR-200共转染进入HEK293细胞中。荧光素酶活性 分析结果表明:当SNP rgi045385位点A替换为C后抑制了miR-200b、miR-200c和miR-429结合到AP-2a的3’
UTR上。为了进一步证明这个结论,我们构建了包含两种不同SNP等位型的全长AP-2a(包含完整的编码区和3
UTR)表达质粒pMyc.AP-20t(A)和pMyc-AP-2ct(c),然后将其分别与miR-200b、miR-200c和miR-429共转染到 HEK293细胞中。Western结果分析表明AP-2a的3’UTR中rsl045385位点A改变为C后,干扰了miR-200b、miR. 200c和miR-429与AP-2a基因3’uTR的结合,从而导致AP-2a的表达上调。
为了研究AP-20t基因SNP位点rsl045385与子宫内膜癌细胞化疗敏感性的关系,我们将包含两种不同SNP (rsl045385)等位型(A或C)的AP-2ct表达质粒pMyc.AP-2et(A)和pMyc—AP-20t(C)分别转染到子宫内膜癌细胞 HEC.1.A中,并用不同浓度的顺铂处理。MTI实验、Hochest染色实验和克隆形成实验等结果表明:转染pMyc.AP. 2仪(C)的细胞对顺铂更加敏感,而转染pMyc—AP-2et(A)的HEC-1-A细胞对顺铂的敏感性与对照细胞无明显差别。
本论文结果表明miR-200家族在子宫内癌细胞中通过抑制AP-2cx的表达来降低细胞对顺铂的敏感性,SNP位
点rsl045385可以作为一个潜在的子宫内膜癌患者顺铂治疗的预后标志。
:It电子信箱:jlzhou@hunnu.edu.cn
Bayes判别分析在基于儿茶酚胺的阿尔茨 海默病预测研究中的应用
李佐静1’:{ 李 清2 宗东升1 毕开顺2+
(1沈阳药科大学医疗器械学院沈阳2沈阳药科大学药学院 沈阳110016)
阿尔茨海默氏症(Alzheimer’S disease,AD)是一种退行性神经系统疾病,是最常见的老年痴呆症。儿茶酚胺 (Catecl&olamines,CA)是一种含有儿茶酚和胺基的神经内源性物质,最重要的是肾腺素,去甲肾上腺素和多巴胺。 在研究过程中,利用Bayes判别分析方法将12个AD患者和12个健康人尿液cA(肾上腺素E、去甲肾上腺素NE、 多巴胺DOA、左旋多巴L.DOPA和3,4.二羟基苯乙酸DOPAC)5种含量指标作为训练集来进行判别公式的建立, 通过测量E,NE,DOA,L.DOPA和DOPAC的值到健康组和AD患者组的线性判别函数分别为:
.19.91024+0.21873木E+0.23742丰NE+0.11155半DOA+0.41789誊L—DOPA-0.12661;I:DOPAC(1)
-2.24864+0.03070术E+0.04914:lc NE+0.06892木DOA+0.01704丰L—DOPA+0.01598:Ic DOPAC(2)
交叉验证错误率为4.27%,并且采用随机余下的4个数据带入判别函数,进行预测,结果表明具有很好的预测 能力,正确率达到了100%。这样就可以把怀疑该病的人将其cA含量指标带人判别公式进行计算,根据判断界值 进行判断分类,即诊断AD病患者。此方法可以通过测量人体尿液中cA含量测定及浓度来诊断A
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