武汉大学分子模拟实验第十二章生物大分子模拟.pdfVIP

武汉大学化学与分子科学学院 《分子模拟实验》实验报告 生物大分子模拟 指导老师：侯华 姓名：陆文心 专业：化学弘毅班 学号：2012301040179 日期：2014 年12 月18 日（周四下午） 一、实验内容 问题12-3-1 获得PDB 号为“1HCK”的蛋白（human cyclin-dependent kinase 2,i.e. ， CDK2 和ATP 的结合晶体结构），并采用不同的模型观察其结构特点。 查阅文献可知，CDK2 的第81 号Glu 与ATP 分子的嘌呤环上N6 上的氢、第83 号Leu 与ATP 分子的嘌呤环上N1 上的氢之间存在氢键，如下图： 1 参考文献： [1] Mark P. Thomas, Campbell McInnes, Peter M. Fischer, Protein Structures in Virtual Screening: A Case Study with CDK2. J. Med. Chem. 2006, 49, 92-104 [2]