长非编码RNA与蛋白质的相互作用.docxVIP

宋旭，男，博士，四川大学教授，博士生导师。从1999年起，开始研究长非编码RNA与蛋白质相互作用的机制及其生理病理意义。最早报道了长非 编码RNA 与蛋白质相互作用参与肿 瘤发 生发展 的机制，发现小鼠 宋旭，男，博士，四川大学教授，博士生导师。从1999年起，开始研究 长非编码RNA与蛋白质相互作用的机制及其生理病理意义。最早报道了长非 编码RNA 与蛋白质相互作用参与肿 瘤发 生发展 的机制，发现小鼠的VL 30 RNA与PSF蛋白相互作用，解除PSF蛋白对原癌基因转录的抑制作用，从而促 进黑色素瘤细胞转移。针对长非编码RNA功能研究的难点，建立了筛选与目 标蛋白质相互作用的长非编码RNA的技术平台(RNA-SELEX-seq)，为长非编 码RNA筛选及功能研究提供了重要技术手段。以第一作者和通讯作者身份在 PNAS上发表了5篇论文。 长非编码RNA与蛋白质的相互作用 兰 洋，宋 旭* (四川大学生命科学学院功能基因组实验室，成都 610064) 摘要：长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸但缺乏蛋白质编码潜 力的调控型RNA。lncRNA在真核生物基因组中广泛转录，并且能够在多种层次以灵活的方式对基因 表达进行调控。lncRNA能够与染色质修饰复合物及转录因子等蛋白质相互作用，这种相互作用提高 了基因表达调控的灵活性和复杂性。本文将介绍部分具有代表性的lncRNA-蛋白质相互作用及其在基 因表达调控中的作用。 关键词：长非编码RNA；lncRNA-蛋白质相互作用；基因表达调控 Interaction of long non-coding RNA and protein LAN Yang, SONG Xu* (Center for Functional Genomics and Bioinformatics, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu 610064, China) Abstract: Long non-coding RNAs (lncRNAs) are transcripts larger than 200 nt in length with limited pro- tein-coding potential. Eukaryotic genomes are pervasively transcribed into tens of thousands of lncRNAs. LncRNAs play widespread roles in gene regulation by diverse mechanisms. LncRNAs interact with protein partners such as chromatin-modification proteins and transcription factors. These lncRNA-protein interactions increased the flexibility and complexity of gene regulation. Here we review representative lncRNA-protein interactions and their roles in the regulation of gene expression. Key words: long non-coding RNA; lncRNA-protein interaction; regulation of gene expression 基因组中蕴藏着物种的全部遗传信息，储存 在DNA序列中的信息可以通过转录传递到mRNA 中，再通过翻译合成蛋白质而发挥生物学功能。 然而，在真核生物基因组中，随着物种复杂程度 收稿日期：2014-07-15 基金项目：教育部博士点基金优先发展领域(20130181130010) *通信作者： E-mail: xusong@scu.edu.cn · 474 ·《生命的化学》2014年34卷4期专题：RNA研究的提高，蛋白质编码基因的数量却没有明显增加，而非蛋白质编码序列的比例却显著提高[1]，并 · 474 · 《生命的化学》2014年34卷4期 专题：RNA研究 的提高，蛋白质编码基因的数量却没有明显增 加，而非蛋白质编码序列的比例却显著提高[1]，并 且这些非编码序列普遍转录[2,3]。例如：在人类基 因组中，74.7%的序列能够转录成RNA，但全部 mRNA的外显子序列却仅占2.94%，其余的序列信 息则以非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)