扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析.pdfVIP

－ 生物安全学报 ２０１７ꎬ２６(２):１１１ １２１ ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＢＩＯＳＡＦＥＴＹ ｈｔｔｐ:∥ｗｗｗ.ｊｂｓｃｎ.ｏｒｇ ＤＯＩ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.２０９５￣１７８７.２０１７.０２.００２ 扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析 １ꎬ２ ３ １ꎬ２ １∗ ２∗ 田浩楷 ꎬ张　 帅 ꎬ柳小龙 ꎬ张志伟 ꎬ赵莉蔺 １ ２ 山西农业大学林学院ꎬ山西太谷０３０８０１ꎻ 中国科学院动物研究所ꎬ农业虫害鼠害综合治理研究国家重点 实验室ꎬ北京１００１０１ꎻ３ 中国农业科学院植物保护研究所ꎬ植物病虫害生物学国家重点实验室ꎬ北京１００１９３ 摘要:【目的】松材线虫作为林业重大外来入侵种ꎬ扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用ꎬ但扩散虫态的形 成与维持机制尚未阐明ꎮ 【方法】通过构建松材线虫数字基因表达谱(ＤＧＥ)ꎬ从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方 面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异ꎮ 【结果】参考松材线虫基因组数据ꎬ鉴定出２种扩散型幼虫(Ｌ ꎬＬ )和繁殖型 Ⅲ Ⅳ 幼虫(Ｌ )各有 １１１８４、８５３３和１０７８１个基因ꎮ 相对于繁殖型虫态ꎬ大多数基因在Ｌ 中下调表达ꎬ该虫态中特异上调表达的 ｎ Ⅳ 基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因ꎮ 推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关ꎬ并在其生理功 能如化学感受和媒介/ 寄主互作中发挥作用ꎮ ＧＯ和Ｐａｔｈｗａｙ富集分析显示ꎬ多数代谢相关通路在Ｌ 中下调表达ꎬ而在Ｌ Ⅳ Ⅲ 中的表达均活跃ꎮ 【结论】以上结果与Ｌ 处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致ꎮ Ⅳ 关键词:松材线虫ꎻ扩散型虫态ꎻ数字基因表达谱ꎻ差异表达基因 Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｄｉｓｐｅｒｓａｌａｎｄｐｒｏｐａｇａｔｉｖｅｌａｒｖａｌｓｔａｇｅｓ ｉｎｔｈｅｐｉｎｅｗｏｏｄｎｅｍａｔｏｄｅ (Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓ) ｂａｓｅｄｏｎａｄｉｇｉｔａｌｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｌｉｂｒａｒｙ １ꎬ２ ３ １ꎬ２ １∗ ２∗ ＴＩＡＮＨａｏｋａｉ ꎬＺＨＡＮＧＳｈｕａｉ ꎬＬＩＵＸｉａｏｌｏｎｇ ꎬＺＨＡＮＧＺｈｉｗｅｉ ꎬＺＨＡＯＬｉｌｉｎ １ ２ ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙꎬＳｈａｎｘｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＴａｉｇｕꎬＳｈａｎｘｉ ０３０８０１ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ＳｔａｔｅＫｅｙＬａｂｏｒ