第八章育种的遗传评估（三）---BLUP育种值估计.pptVIP

第六节 BLUP育种值估计举例 单性状动物模型BLUP育种值估计 某种猪场有如下种猪性能测定资料，测定性状为达100 kg日龄，已知该性状的遗传力为0.33，试对该性状资料进行个体育种值估计。 种猪达100kg日龄记录 猪场 个体 父亲 母亲 达100kg日龄 1 1 — — 140 1 2 — — 152 1 3 1 — 135 2 4 1 2 143 2 5 3 2 160 个体间加性遗传相关矩阵的计算 个体间加性遗传相关矩阵逆矩阵的计算 构建 ： 个体间加性遗传相关矩阵逆矩阵的计算 构建对角矩阵： 令： 构建线性模型 根据资料性质，可对种猪达100kg日龄写出如下动物模型： 用矩阵形式表示，则对于该资料有： 构建混合模型方程组 因此有： 求解混合模型方程组有： 两性状动物模型BLUP法育种值估计 某种猪场有如下种猪性能测定资料，测定性状为达100 kg日龄和达100kg背膘 ，试以两个性状资料进行个体育种值估计。 种猪达100kg日龄和达100kg背膘厚测定记录 猪场 个体 父亲 母亲 达100kg日龄(d) 达100kg背膘厚（mm） 1 1 — — 140 13 1 2 — — 152 14 1 3 1 — 135 12 2 4 1 2 143 13 2 5 3 2 160 16 根据资料性质，可对种猪达100kg日龄和达100kg背膘厚写出如下动物模型： 是第 性状，第 猪场，第 个体的观测值 是第 性状，第 猪场的效应 是第 性状，第 个体的育种值 是随机残差 猪两个性状的表型、遗传参数和经济加权值 （表中右边2项的右上角为表型相关，左下角为遗传相关） 性状 单位 达100kg日龄（ ） d -0.6 0.33 225 — 0.55 达100kg背膘厚（ ） mm -0.8 0.50 1.44 0.45 — 因为所有个体两个性状都有记录，因此有 加性遗传相关矩阵的逆矩阵（单性状例子获得）： 由遗传参数表可计算出性状间的遗传和误差方差及协方差为： 逆矩阵为： 混合模型方程组： 方程组的解为： 综合育种值为： 第六节：BLUP育种值得准确性与重复率 估计育种值准确性的定义是真实育种值与估计与育种值之间的相关（raa）。 估计育种值（EBV）准确性的平方则称为“估计育种值重复率”或叫做“估计育种值可靠力”。 规律：估计个体育种值时所利用的亲属信息愈多，EBV值得准确性就愈高，反映在重复率值上就愈大。反之，重复率值愈大，就表示EBV的准确性愈高，EBV值就愈稳定。 第七节：BLUP育种值估计软件 一、PEST 二、PIGBLUP 三、GBS 四、NETPIG 结束 模板来自于 / * 模板来自于 / * 模板来自于 / * 第八章 育种的遗传评估（三）---BLUP育种值估计 小组成员：李功铺201311331212 李永平201311331213 林潇帆201311331215 目 录 / Contents 01 02 03 04 05 第一节 有关预备知识 第五节 多性状的BLUP育种值估计 第二节 BLUP的基本原理 第三节 BLUP育种值估计模型 第四节 单性状的BLUP育种值估计 第六节 BLUP育种值的准确性与重复率 第七节 BLUP育种值估计软件 预备知识 BLUP的基本原理 估计模型 单性状BLUP育种估计 多性状育种值估计 BLUP育种值准确性与重复率 估计软件 分块矩阵、逆矩阵、广义逆矩阵 随机向量、期望向量、方差-协方差矩阵和正态分布 模型：真实模型、理想模型、操作模型 线性模型：固定效应模型、随机效应模型、混合模型 基本理论、混合模型方程组、BLUP由来 估计软件：PEST、PIGBLUP、GBS、NETPIG、 B L U P 育 种 值 估 计 动物模型 公畜模型 公畜-母畜模型 外祖父模型 个体间加性遗传相关矩阵A与Aˉ1的计算 计算个体育种值 第一节 有关预备知识 第一节 有关预备知识 第一节 有关预备知识 线性模型 ：线性模型是指在模型中所包含的各个因子是以相加的形式影响观察值，即它们与观察值的关系为线性关系，但对于连续性的协变量也允许出现平方或立方项。 线性模型的组成： 1、 数学方程式 2、方程式中随机变量的期望和方差及协方差 3、假设、约束和限制条件 分类 1 固定效应模型 如一个模型中除了随机误差