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新城疫病毒(NCV)荧光定量RT-PCR
检测试剂盒操作手册(第一版)
适用于各种食品类材料、卫生
监督、疾病控制等来源的临检样品
2006.12
深圳易瑞生物技术有限公司
试剂盒组成
产品目录号
规格
48次检测
新城疫病毒RT-PCR一步法反应液
1080μl / 1管
逆转录酶(5U/μl)
24μl / 1管
Taq酶(5U/μl)
20μl / 1管
新城疫病毒阳性对照
100μl / 1管
新城疫病毒阴性对照
100μl / 1管
操作手册
1份
注:本试剂盒不包括新城疫病毒RNA提取试剂,用户可采用通用型病毒RNA提取试剂盒或试剂盒推荐的提取方法。
产品介绍
本试剂盒采用TaqMan探针法实时荧光PCR技术,用于禽肉、禽类组织脏器、禽类排泄和分泌物,及其泄殖腔和咽喉拭样中的新城疫病毒的检测。符合行业标准SN/T 1686-2005《新城疫病毒中强毒株检测方法:荧光RT-PCR法》的检测要求。
检测灵敏度:对于接种的鸡胚尿囊液,检测的最高稀释度可达10-8~10-7,与鸡胚病毒分离方法的灵敏度接近。定量检测线性范围可达10-1010拷贝/ml。
特异性:本试剂盒根据新城疫病毒的fusion protein基因最新DNA序列设计,并通过系统验证,能够检测所有已知新城疫病毒毒株。对于其它禽类感染因子,本试剂盒检测结果为阴性。
贮存与运输条件
本试剂盒必须在-20℃下避光保存,有效期为6个月。
需在低温下运输。
注意事项
本试剂盒仅用于体外检测使用,操作人员必须经过培训并具有一定的经验,试剂盒使用前请仔细阅读说明书全文。
请严格按照基因扩增检验实验室的管理规范进行实验操作:如PCR实验严格分区操作;各区应有专用的手套、移液器等,不得交叉使用,避免污染;工作人员应遵循从一区到二区的单方向工作原则,各工作区相对隔离;进行PCR实验的工作桌面和及相关物品应定期用1%次氯酸钠、75%酒精、1mol/L盐酸或紫外灯进行灭菌和消毒。
所用的吸头和离心管都需要经DEPC水处理,以灭活RNA酶,75%乙醇也要用DEPC处理过的水配制。
试剂盒中各试剂充分融化后请短暂离心。反应液分装时应尽量避免产生气泡。上机前应注意检查各反应管是否盖紧,以免污染仪器。
适用荧光PCR仪品牌与型号
Cepheid公司的SmartCycler
ABI公司的Prism7000、7700、7500、9600系列
Stratagene公司的MX3000、MX4000
Corbett Research公司的Rotor-Gene 3000
Bio-Rad公司的iCycler系列、MJ opticon2
Roche公司的LightCycler等
实验操作步骤
RNA提取:用户可采用通用型病毒RNA提取试剂盒提取新城疫病毒RNA用于检测或保存于-20℃(
扩增试剂准备(在试剂贮存和准备区完成)
从试剂盒中取出RT-PCR一步法反应液,冰盒上融化后混匀,取出Taq酶和逆转录酶。试剂在使用前2000rpm离心20s。
设需要的PCR反应管管数为N(N = 待检样本数X份 + 1管阴性对照 +1管阳性对照)。
MIX的配制:首先吸取反应混合液至1.5ml灭菌离心管,体积22.1×N (μl),再加入Taq DNA聚合酶0.4×N (μl)和逆转录酶0.5×N (μl)到1.5ml灭菌离心管,混匀后短暂离心(2000rpm/20s),然后向N 个0.2ml PCR反应管中分装已加入Taq酶和逆转录酶的MIX各23μl/每管,盖紧管盖。每个测试反应体系配制为:PCR反应液22.1μl+0.4μl Taq酶+0.5μl逆转录酶。
注意:阴性对照管建议在此区中加入2μl阴性对照样品。
加样(在样品制备区完成)
阳性对照取出解冻,使用前2000rpm 离心20s。
若样本提取物保存在-20℃,则在使用前置室温解冻;向N个PCR管中分别加入待检样本RNA(包括阳性对照)2μl,盖紧管盖,2000rpm离心20s,将PCR反应管转移至核酸扩增区。注意做好样品号标记。
PCR扩增(在核酸扩增区完成)
上机前应检查各反应管是否盖紧。
反应体系设为25μl;荧光信号采集设定在退火温度。对于多通道荧光PCR仪,选择荧光素FAM为信号采集通道。
PCR循环参数为:第一阶段,50℃ 30 min反转录
第二阶段,95℃
第三阶段,[95℃ 10s;60
质量控制标准及结果判断
阴性对照CT值应显示为0或≥40.0,阳性对照的CT值应≤30.0,否则视实验失败,需重做。
检测样品CT≤35.0,结果有效,可直接报告样品阳性;
检测样品35.0CT40.0,需进行一次重复实验,若CT仍介于35.0和40.0之间,且曲线有明显的指数增长特性,同时阴性对照Ct值为零,可报告样品阳性
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