阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶点的生物信息学.PDFVIP

J South Med Univ, 2019, 39(10): 1141-1148 doi 10.12122/j.issn. 1673-4254.2019.10.02 ·1141 · 阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶点的生物信息学阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶点的生物信息学 分析分析 1，2 ，3 1，2 ，3 1，2 4 5 朱星枚 ，杨嘉妮 ，张恩户 ，乔 炜 ，李学军 1 2 3 陕西中医药大学药学院药理学教研室，陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室，陕西省中 4 5 药基础与新药研究重点实验室，陕西 咸阳 712046 ；中国兵器工业五二一医院，陕西 西安 710065 ；北京大学 医学部药理学系，北京 100191 摘要：目的基于生物信息学分析大量公共数据库，探讨阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的分子机制。方法 利用Drug Bank 5.1.3 搜索确定阿司匹林的直接靶点蛋白（DPTs），STRING 在线构建阿司匹林DPTs 的蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络和信号通 路；使用cBio Portal 研究人乳腺癌中DPTs 基因突变，并利用OncoPrint 可视化；从TCGA 数据库下载乳腺癌与正常组织中的转 录组数据，利用DECenter 分析差异过表达基因，对STRING分析得到的DPTs 相互关联基因与TCGA 中的差异过表达基因求交 集，确认阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点，并利用Gene Ontology 进行GO 功能富集分析。最终通过蛋白免疫印迹 实验验证阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点。结果 搜索Drug Bank 5.1.3 确定了11个阿司匹林DPTs ，KEGG 通路富 集表明其中6 个DPTs （EDNRA ，IKBKB ，NFKB2 ，NFKBIA ，PTGS2 和TP53）与癌症发生发展有关。通过分析TCGA 数据库中 乳腺癌与正常组织中的转录组数据获得10220个过表达差异基因，与STRING分析得到的6个阿司匹林DPTs 的相互关联基因 求交集，发现4 个基因（CDC25C ，TPX2 ，CDC20 ，PLK 1）可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点，其基因功能主要富 集于细胞周期与细胞分裂。蛋白免疫印迹实验结果显示：阿司匹林可以降低人乳腺癌细胞中CDC25C ，TPX2 ，CDC20 ，PLK 1 的 蛋白表达。结论 CDC25C ，TPX2 ，CDC20 和PLK 1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点，其可能通过影响细胞周 期和细胞分裂发挥抗肿瘤增殖作用。 关键词：阿司匹林；人乳腺癌；生物信息学；细胞周期；细胞分裂 Bioinformatic analysis of direct protein targets of aspirin against human breast cancer proliferation 1, 2, 3 1, 2, 3 1, 2 4 5 ZHU Xingmei , YANG Jiani , ZHANG Enhu , QIAO Wei , LI Xuejun 1Department of Pharmacology, Shaanxi University of Chinese Medicine, 2Key Laboratory of Pharmacodynamics and Material Basis of Chinese Medicine of Shaanxi Administration