生物医学信息学-医学演示课件-精选.pptVIP

观察、分析、行动 * 诊断－治疗循环 * 生物信息学（Bioinformatics)概念 美国人类基因组计划实施五年后的总结报告中，对生物信息学作了以下定义： 生物信息学是一门交叉科学，它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方面，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具，来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。 * 生物信息学核心观点： 生命现象是在信息控制下不同层次上的物质、能量与信息的交换。 是信息在不同层次的传递过程：核酸、蛋白质、细胞、器官、系统、整体。 * 广义的生物信息学 生物的遗传信息学：DNA-RNA-蛋白质、遗传信息-转录-翻译 生命活动的调控：基因的功能、表达和调控蛋白质的结构、功能。 生物电磁学与电磁生物学： 生物电磁学： 人体的电磁辐射： 人体信号的调制方式； 电磁生物学 * 视觉系统与光信息处理 视网膜神经元回路与信息处理、彩色视觉及彩色图象的编码、变换机制等。 脑和神经系统与信息： 脑感知觉信息处理原理及其应用，学习、记忆、思维模型与信息系统新原理研究。 生物结构与微光机电系统： DNA驱动的微细机器人 生物大分子到细胞基本结构体系的自组装、自组织 创造新物质的分子工程学研究 基因芯片、蛋白质芯片 * 狭义的生物信息学 基因层次的生物信息学 综合利用生物学、数学、物理学、信息科学以及计算机科学的交叉学科。 把基因组DNA序列信息作为信息分析的源头，获得蛋白质编码区的信息之后进行蛋白质空间结构模拟和预测。 核心是基因组信息学：基因组信息的获取、处理、存储、分配和解释。 发现新基因信息后进行蛋白质空间结构拟合预测，依据蛋白质的功能进行药物设计。 * 医学信息学的学科体系 医学信息学基础研究 医学信息技术研究 医学信息标准化研究 医学信息有序化研究 医学信息获取方法研究 医学信息交流研究 医学图象分析与处理技术研究 医学信息系统研究 医学决策支持系统研究 医学知识管理研究 * 医学信息学研究进展 医学数据挖掘理论、技术与方法的研究 领域数据库与跨库检索 循证医学信息资源的研究 统一的医学信息标准研究 基于WEB的电子病历系统研究 整合的医疗信息系统研究 智能化医学专家系统研究 小波理论在医学图象处理中的研究 社区卫生和公共卫生系统的研究 * 2、决策支持系统与数据仓库 决策支持系统（DSS）：从数据库中找出必要的数据，并利用数学模型的功能，为用户产生所需的信息。 数据仓库和数据挖掘 数据仓库：是一个面向主题的、集成的、稳定的、包含历史数据的数据集合。它用于支持经营管理中的决策制定过程。 数据仓库的概念对收集不同来源的数据从新的角度提出了一种新的结构方法 数据仓库的根本任务：把信息加以整理归纳并及时提供给管理决策人员。 主要作用：提供报表和图表、支持多维分析、数据挖掘的基础。 * go go go go go go go go go go go go 生物医学信息学 浙江中医药大学信息技术学院 王海舜 * 课程学习目的和要求 教学目的:通过本课程的学习，掌握医学信息学的基本原理，能用医学信息学的方法和计算机技术开展医学研究。 课程内容: 医学信息学 生物信息学 * 医学信息学基础 医学信息标准化 临床信息系统 医学信息有序化 医学信息获取 PACS系统及其实现 医学信息的硬件架构和信息安全 临床信息系统 临床路径 无线网络 医学决策支持 生物信息学概论 生物数据库 序列对比和数据库搜索 课程的内容 * 课程教学目的和要求 教学方法: 理论课 实验课 医院信息化建设见习、调研 讨论课 考核办法 综述、调研报告、实验报告40％ 教学参与情况（讨论课、上课参与）10％ 考试50% * 教材和参考书目 教材:王伟.医学信息学.高等教育出版社，2006，2 参考书目： (荷兰)J.H.Van Bemmel (美国)M.A.Musen 主编 包含飞 郑学侃 主译，医学信息学，上海科技出版社。 傅征等，医院信息系统建设与应用，人民军医出版社，2003，3 金新政等，医院信息系统，科学出版社， 2004.1 黄晓鹂主编，医学信息学教程，中国科学技术出版社 * 第一章 医学信息学基础 第一节 医学信息 信息的含义 信息存在的普遍性 信息概念的表述 各家学说：归纳为五种主要学说 国家标准（GB/T4894-1985）：是事物变化和特征的反映；是事物间相互联系的表征；是事物在特定信息载体上的映射或再现 信息的特征 语法 语义 语用 * 医学信息学（Medical Informatics）概念： 医学信息是指医学、医疗卫生和公共健康或药学、药物为信息内容和应用领域的各种信息。 传统的医学信息学－－侧重文献信息管理、分析