23基因组学与蛋白质组学.ppt

科学出版社案例式教材《生物化学》课件 （一）HGP的诞生和启动 一、人类基因组计划(Human Genome Project) （二）HGP的实施和进展 2. 对一系列模式生物体基因组的全序列测定 二、基因组学的提出 1986年，美国科学家Thomas Roderick首次提出基因组学（genomics） 现在的基因组研究包括 * 以全基因组测序为目标的结构基因组学（structural genomics） *以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functional genomics） 又被称为后基因组学。 三、蛋白质组学的产生 蛋白质组（proteome） 一个基因组、一个细胞或组织或一种生物体所表达的全部蛋白质。 一个生物体的基因组是相对稳定的，而蛋白质组则是一个动态的概念 蛋白质组学（proteomics） 第2节 基因组学研究 一、基因组学的概念 基因组学是研究生物体基因组的结构、结构与功能的关系、以及基因之间相互作用的科学。 包括基因组作图、核苷酸序列分析、基因定位、基因功能分析及调控研究等。 分为结构基因组学和功能基因组学 二、基因组学的研究内容 （一）结构基因组学 遗传图谱： 通过遗传重组所得到的基因或DNA标记在染色体上的线性排列图谱。 图距单位：cM（厘摩） 遗传标记： 限制性片段长度多态性（RFLP） 限制性片段长度多态性（ RAPD ） 扩增片段长度多态性 （AFLP） 短串联重复序列（STR） 单核苷酸多态性 （SNP） 物理图谱： *以序列标志位点（STS）为作图标志，图距以bp、kb、Mb为单位的基因组图谱。 * DNA序列分析和基因组结构研究的基础。 序列图谱： 是物理图谱的延伸，是最详细、最准确的物理图谱。 功能基因组学是建立在结构基因组学研究基础上的基因组分析 。 1．识别和鉴定基因信息 2．注释基因产物的功能 3．研究基因组的表达调控 4．研究基因组的多样性 5．比较基因组学研究 三、基因组学相关学科的诞生 新生学科： 疾病基因组学（disease genomics） 药物基因组学（phamarcogenomics） 营养基因组学（nutritional genomics） 环境基因组学（environmental genomics） 病理基因组学（pathogenomics） 生殖基因组学（reproductive genomics） 群体基因组学（population genomics） 生物信息学（bioinformatics） *蛋白质组学是从整体水平研究细胞内蛋白质的组成、结构及其活动规律的科学。 *蛋白质组学是对不同时间和空间发挥功能的特定蛋白质群体的研究 *总体上分为： 对蛋白质表达模式的研究 对蛋白质组功能模式的研究 二、蛋白质组学的研究内容 蛋白质组作用、成分鉴定、数据库构建、新型蛋白质的发现、同源蛋白质比较、蛋白质加工和修饰分析 基因产物识别、基因功能鉴定、基因调控机制分析 及对蛋白质表达后在细胞内的定位研究 重要生命活动的分子机制研究 分子医学方面的研究 三、蛋白质组学研究技术体系 蛋白质组学研究包括三个主要步骤： 蛋白质分离 蛋白质鉴定 鉴定结果的存储、处理、对比和分析 蛋白质组学研究技术体系包括： 样品制备、双向凝胶电泳、蛋白质染色、凝胶图像分析、蛋白质分析、蛋白质组数据库 其中双向凝胶电泳技术、质谱技术、计算机图像分析与数据处理技术是三大基本支撑技术 （一）蛋白质分离技术 蛋白质分离技术主要包括双向凝胶电 泳、双向高效柱层析等 1．双向凝胶电泳 第一向是基于蛋白质的等电点不同采用 等电聚焦的方法分离 第二向是按分子量大小的不同采用SDS分离 2．双向高效柱层析 先将蛋白质混合样品进行一次凝胶过滤（分子筛）层析 再利用蛋白质表面疏水性质进行反向柱层析分离 （二）蛋白质鉴定技术 Edman降解法测定N-末端序列 质谱技术 氨基酸组成分析 （三）生物信息学 生物信息学常由数据库、计算机网络和应用软件三大部分组成 能高效地进行基因组、蛋白质组数据分析，而且可以对已知或新的基因产物进行全面的功能分析 （四）蛋白质相互作用的研究方法 常规技术：蛋白质亲和层析、免疫印迹、免疫共沉淀及蛋白质交联 等