dna损伤与修复和染色质维护.pptxVIP

厦门大学研究生课程：《分子细胞生物学》;第4章：DNA损伤与修复和 染色质组装与维护;细胞中的DNA包含着完整的遗传信息，真核生物DNA与组蛋白相互作用形成高度有序的染色质。DNA与染色质在配子与合子形成、以及之后个体生长发育的细胞活动与基因表达过程中，都处于一种动态变化。 正常细胞具有一整套修复DNA损伤和染色质维护系统，以维持基因组稳定与DNA的完整，确保遗传信息准确无误地传至下一代，以及细胞功能的正常执行。 DNA损伤及其修复与染色质组装及其维持，都直接损害基因组的稳定性。基因组的稳定性遭到破坏，会导致多种遗传、代谢性疾病或肿瘤的发生。因此对基因组稳定性调控和DNA修复机制的研究，是生物医学科学的重要领域。;第一节 DNA损伤的修复及其他响应系统;(1)碱基缺失(base loss) DNA上的脱氧核糖和碱基的糖苷键在生理条件下并不太稳定，哺乳动物细胞中每天会有几千个嘌呤和几百个嘧啶的自然缺失，产生无嘌呤或无嘧啶位点 (AP site, apurininc/apyrimidic site) (thermal disruption? depurination);(2)碱基修饰(base modification)—主要3类;化学修饰: DNA可以被很多化学修饰 。细胞氧化代谢过程中，或细胞受到电离辐射作用后 会产生;(3)复制错误( replication errors) 尽管DNA聚合酶非常精确，而且大多数复制过程中产生的错误都会被迅速消除，但复制系统并非完美，DNA复制过程仍然会产生碱基的错配、插入或丢失的错误。 (4)链间交联( interstrand crosslinks，ICLs) 指不同DNA链上的碱基间发生连接，主要由一些双功能烷化剂如补骨脂素(psoralens) 引起，UV 照射与电离辐射也会导致链间交联 (5) DNA-蛋白交联( DNA-protein crosslinks) DNA拓扑异构酶在催化反应时会与DNA之间形成共价键，通常这种共价键是瞬时可逆的，但偶然也会发生这个共价键没及时断开而形成DNA与蛋白之间稳定的交联。 (6) DNA 断裂( DNA strand breaks) 正常细胞代谢过程中，拓扑异构酶、核酸酶、复制叉的崩溃(collapse)和一些修复过程中都可能产生DAN单链或双链的断裂，但发生的概率特别低。较强的电离辐射可导致 DNA 断裂。 ;二、DNA损伤的修复（DNA repair);（一）直接修复(direct reversal);（2）甲基鸟??呤甲基转移酶(MGMT) 介导的修复;（二）切除修复(excision repair);多数糖苷酶只识别一种损伤。 虽然细胞中有多种糖苷酶，但是它们无法对付所有的DNA损伤。;核苷切除修复(NER):是一种更灵活的DNA修复机制，通过识别DNA上不正常的结构和不正常的化学特性来识别DNA损伤并且将这些受损的核苷酸切除。 核苷酸切除修复的过程更加复杂，参与的蛋白更多。表5-2中列出了在核苷酸切除修复中发挥重要功能的蛋白分子及其可能参与的步骤。其中有些蛋白识别损伤位点，有些蛋白参与对核苷酸的切除。这些蛋白大多都有相互作用并且形成一个大的复合体。 核苷酸切除修复的过程：首先由多聚体复合物识别损伤，再在损伤的两侧进行切除。随着DNA链被解开，包含损伤的单链片段释放出来，留下的缺口由DNA聚合酶填补，DNA连接酶封闭。该途径包括20种以上蛋白，可以修复紫外辐射诱导的环丁烷嘧啶二聚体(CPD)和一些化学物质产生的大加合物。 NER可再分为两条子途径 (1) 全基因组修复(globalgenomic repair，GGR)途径:修复整个基因组内的损伤，其效率取决于损伤的化学特性、损伤部位的DNA序列和染色质结构。 (2)转录偶联修复(trancsription-coupled repair，TCR)途径:特异地修复基因组中具有转录活性的基因的被转录DNA链上的损伤，该途径的特点是依赖RNA聚合酶Ⅱ催化的转录，其中的一些蛋白是普通转录因子TF IIH的亚基。;错配修复(mismatch repair，MMR)：主要负责修复DNA复制过程中产生的错误配对的碱基。它通过检查新生DNA链有无错配碱基，并将其切除，以正确的序列补上缺口。 错配修复基因的认识首先来源于对E．coli的研究。E．coli中承担错配修复主要任务的是MutS (Mutator S)、MutL和MutH, 它们都是同源二聚体的形式结合在DNA上发挥功能的。MutS会识别新生链上的错配碱基并结合上去，随后MutL也会结合在这个DNA-蛋白的复合体上并且对它们的结合起着稳定的作用。MutS-L复合物会移位到GATCm位点，激活结合