打破壁垒新型可视化工具.pptxVIP

第1页/共21页 随着数量和数据输出复杂性的增加，尖端前沿的可视化工具显得尤为重要。微阵列数据和其他数据准确的翻译有助于揭示趋势，异常，和发现关键药物重要决策的模式。 同样重要的是巨大的套复合数据的管理。公司提供的新工具包括改进的多路复用系统，细胞的高通量分析或者筛选，使用新的分子标记，和灵活的、可定制的数据管理软件。第2页/共21页新型可视化工具——几种主要的系统及软件（一）改进的多路复用系统 （二）数据管理软件（三）高温超导（HTS） 第3页/共21页（一）改进的多路复用系统 复用——多个样品平行分析，有助于满足高吞吐量的要求。 Beckman公司（）开发了一种芯片技术，使多达13个不同的分析物或表达的蛋白质在细胞培养，血清或血浆样品同时定量。据系统生物学中心业务战略业务经Brendan Yee报告：该A2芯片系统可以在不到5分钟的时间内从一个单一的微孔板提供超过一千的结果，对科学家们来说可理想用于分析和检测，二次药物筛选，临床研究。”最初的方法使用一个通用的连接使用的寡核苷酸作为连接或邮政编码，允许用户创建自己的抗体阵列化学。A2芯片系统板的每个孔预先发现13种不同的寡核苷酸序列作为标记或复分析的具体定位器。他们的互补链被列为单独的瓶装试剂在我们的通用连接器套件，研究者用来配对特异性抗体。所以，每一个寡抗体共轭将只能以特定的顺序在孔中与13种独立的分析物结合。从这一点上，它的检测流程与加入样品和分析物的特异性抗体检测的ELISA（酶联免疫吸附剂测定）类似。检测抗体的生物素和链霉亲和素染料的荧光在我们的A2系统得以增加。” 第4页/共21页（一）改进的多路复用系统虽然大多数的检测方法多采用的捕获和检测的单克隆抗体，但是其发展需要历时九个月，花费数万美元。Somalogic（）采用了不同的策略。该公司采用图像试配体，单链核酸结合至少一个的BrdU（代替T核苷酸），当暴露在紫外线光下时（在BrdU和electronrich氨基酸例如酪氨酸之间形成的共价键），可以特异性地将靶蛋白的共价捕获。第5页/共21页（一）改进的多路复用系统 哲学博士、主席以及首席问题官Larry Gold说他们使用图像试配体的阵列在各种复杂的矩阵下同时测量许多不同的蛋白质，包括血清。金博士说该公司专有的图像适配体对目标分析物有很大的亲和力。抗体阵列或质谱法的主要优点是高质量的图像适配体作为捕获试剂，表面图像适配体的稳定性以及能力在SomaLogic通过快速的图像适配体发现以增加内容。 图像适配体阵列可以扩展到非常大的数量的同时分析，因为他们避免了二次捕获剂相关的问题，这是在夹心法检测分析物的检测基础上。最后是对医生和患者最有用的，血清蛋白必须在低femtomolar范围内的浓度，超越所有夹心测定，即使是最昂贵的质谱法。” 第6页/共21页（二）改进的多路复用系统 公司的主要目标是开发基于药的的用法说明的血液测试，结合多种检测结果并提供重要的临床问题的确切答案。根据金博士所言：“单个分析物的血液测试，如果阳性，表明患者更可能有一种疾病验前统计的可能性。 这些试验，然而，远非完美。例如，在PSA筛查时发现大约80%的人得分积极PSA测试，活检后，没有前列腺癌。我们的目标是降低假阳性率，对于大多数测试没有通过疾病的签名功率损失的敏感性。” SomaLogic还计划与战略伙伴合作开发研究中的应用。该公司希望在2005完成更大规模的临床试验，并开始在2006年年中首先应用介绍。”第7页/共21页（二）数据管理软件蜂窝数据挖掘据业内人士透露，基于细胞药物筛选的技术预计到2005年复合增长率将增加到25%（见）。许多公司利用细胞筛选策略在早期因为他们提供的优势评估反应的环境中，最终产品有其药理作用，即，活细胞。但重要的瓶颈出现在定位和挖掘图像。第8页/共21页蜂窝数据挖掘Cellomics公司（）产品包括自动化的高通量筛选（HCS）系统，第五代ArrayScan?HCS阅读器，以及图像分析算法（BioApplications）和高含量的信息（HCI?）。根据博士，高级产品经理，信息学Mark Collins所言，“我们的图像分析软件（BioApplications）提供单个细胞的蜂窝数据，整体的威尔斯，在一个简单的亚群水平，交钥匙方式。一些评估参数包括尺寸，形状，数量和荧光标记，荧光的模式。BioApplications从一般用途的应用程序如房室分析与特定的应用程序，如神经轴突生长和核易位的目标激活。柯林斯博士报告说该公司的人机交互是一个企业级的服务，管理，提供定制的解决方案分析，可视化，和决策的高内涵筛选，分析，和细胞发现数据。第9页/共21页蜂窝数据挖掘Wyeth Research研究人员（Monmouth Junction，NJ）最近使用Cellomics公司的