《园艺植物育种学》第13章3分子标记辅助育种.ppt

* 田振东 植物分子育种 * 作物分子设计育种将在庞大的生物信息和育种家的需求之间搭起一座桥梁，在育种家田间试验之前，对育种程序中的各种因素进行模拟筛选和优化，预测不同亲本杂交后代产生理想基因型和育成优良品种的概率，提出最佳的亲本选配和后代选择策略，从而大幅度提高育种效率。 五 分子设计育种 * 田振东 植物分子育种 * 分子设计育种通过多种技术的集成与整合,对育种程序中的诸多因素进行模拟、筛选和优化,提出最佳的符合育种目标的基因型以及实现目标基因型的亲本选配和后代选择策略，以提高作物育种中的预见性和育种效率，实现从传统的经验育种到定向、高效的精确育种的转化。 * 田振东 植物分子育种 * * 田振东 植物分子育种 * (1) 定位所有相关农艺性状的 QTL； 这一过程包括构建作图群体、筛选多态性标记、构建标记连锁图谱、评价数量性状的表现型和 QTL 分析等步骤。 分子设计育种分3步进行： * 田振东 植物分子育种 * (2) 评价这些位点的等位性变异； 利用已经鉴定出的各种重要育种性状QTL的信息，包括 QTL在染色体上的位置、遗传效应、QTL之间的互作、QTL与背景亲本和环境之间的互作等，模拟预测各种可能基因型的表现型，从中选择符合特定育种目标的基因型。 * 田振东 植物分子育种 * (3) 根据设计进行育种 依据模拟预测各种可能基因型的表现型，从中选择符合特定育种目标的基因型亲本进行田间组配杂交。 　 通过标记辅助选择保留含有目标染色体片段的个体，进一步自交纯化，然后从中选择目标基因型。 * 田振东 植物分子育种 * 粳稻 Asominori 和籼稻 IR24 Asominori 是短粒和宽粒型品种，IR24 是长粒和窄粒型品种 利用粳稻Asominori 和籼稻IR24 构建的染色体片段置换系群体对粒长性状的QTL 定位结果。 * 田振东 植物分子育种 * 3个亲本间的三交组合有可能将需要的染色体片段聚合在一起： 1:(CSSL5×CSSL16)×CSSL19 2:(CSSL5×CSSL19)×CSSL16 3:(CSSL16×CSSL19)×CSSL5 * 田振东 植物分子育种 * 标记选择方案: 产生100个三交 F1 个体，通过标记辅助选择只保留含有目标染色体片段的个体，每个中选个体产生30个 F2 个体，利用单粒传产生 F8 家系，然后从中选择目标基因型。 * 田振东 植物分子育种 * * 黄瓜育种 田振东 * 发现西双版纳黄瓜一个特有的突变。该突变导致西双版纳黄瓜在果实成熟期不能降解 β－胡萝卜素，使得其具有特有的橙色果肉，而不是大部分黄瓜所呈现的白色或浅绿色果肉颜色。 β-carotene hydroxylase (CsaBCH1). * * * 田振东 植物分子育种 * 99% * 田振东 植物分子育种 * 背景选择 (Background selection) 对基因中除了目标基因之外的其他部分 (即遗传背景)的选择。 　　涉及到了整个基因组。要求所用的选择标记能覆盖全基因组，即必须有一张完整的分子标记连锁图谱。 * 田振东 植物分子育种 * 　　背景选择采用均匀分布于全基因组并在亲本间具多态性的分子标记，若BC1F1单株DNA的电泳带型为轮回亲本的纯合带型，则表示该单株在标记位点上已回复到轮回亲本的遗传背景。 * 田振东 植物分子育种 * 在标记信息的辅助下将一个品种(供体)中的一个或多个优良基因导入另一个品种(受体),同时还要尽可能地保持受体群体原有的遗传背景。 前景选择对目标基因携带者选择,以保证目标基因的正确导入（不丢失）,保证从每一回交世代选出的个体包含目标基因。 背景选择,即对受体基因组的选择,以加快受体遗传背景的恢复，同时减轻连锁累赘，以缩短育种年限。 前景选择和背景选择的作用 * 田振东 植物分子育种 * 表型值选择 传统育种对数量性状选择的依据是个体的表型值，可称为表型值选择。(表型值是基型值的近似值) 。 在传统育种中，常通过定向选择来改良数量性状。所谓定向选择就是选择极端表型值的个体，使群体的平均值逐代朝一定方向变化。 (二) 数量性状的的标记选择 * 田振东 植物分子育种 * 基因型选择 更有效的选择方法应是对每个目标QTL利用其两侧相邻标记或单个紧密连锁的标记进行选择（直接依据个体的基因型进行选择)。 数量性状进行基因型选择的困难主要在于，已有的 QTL 定位研究基本上都只定位了部分效应较大的QTL，而且定位的精度不高，尚有许多效应