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《生物信息学概论》课程教学大纲 一、课程名称（中英文） 中文名称：生物信息学概论 英文名称：Introduction to Bioinformatics 二、课程代码及性质 课程代码：0704583 性质：学科大类基础课，必修 三、学时与学分 总学时：16 （理论学时：16 学时） 学分：1 四、先修课程 先修课程：无. 五、授课对象 本课程面向生物信息学专业（含国家生命科学与技术人才培养基地班）学生 开设. 六、课程教学目的（对学生知识、能力、素质培养的贡献和作用） 1 ．介绍本专业的教学、科研与人才培养等情况，帮助学生尽快熟悉专业内 容，逐渐适应大学的学习和生活； 2. 介绍生物信息学研究各个方向的最新进展，使学生对专业研究有一个较 为全面的了解； 3. 介绍生物信息学方面的一些基本研究手段以及所需的知识储备，激发学 生的学习兴趣。 七、教学重点与难点： 课程重点：生物信息学领域各个研究方向的最新进展 课程难点：生物信息学与高通量组学、传统实验生物学之间的关系 八、教学方法与手段： 教学方法：课堂讲授结合幻灯片演示 教学手段：口头语言、文字和书籍、印刷教材和多媒体网络技术 九、教学内容与学时安排 （一）生物信息学专业简介（教师课堂教学学时（4 小时） + 学生课后学 习学时（8 小时）） 教学内容：介绍本专业的发展现状，以及最新的研究成果 课后文献阅读：Wei, L. and Yu, J. (2008) Bioinformatics in china: a personal perspective, PLoS computational biology, 4, e1000020. 课后作业和讨论：根据文献讨论我国生物信息学未来可能的发展方向。 （二）高通量测序技术（教师课堂教学学时（4 小时） + 学生课后学习学 时（8 小时）） 教学内容：介绍高通量组学技术，尤其是测序技术在生物信息学研究中 的应用。 课后文献阅读：Metzker, M.L. (2010) Sequencing technologies - the next generation, Nat Rev Genet, 11, 31-46. 课后作业和讨论：讨论生物信息学与高通量组学和传统实验生物学之间 的关系。 （三）计算系统生物学（教师课堂教学学时（4 小时） + 学生课后学习学 时（8 小时）） 教学内容：介绍网络、复杂性、系统生物学、合成生物学在生物信息学 研究中的应用。 课后文献阅读：Janes, K.A. and Yaffe, M.B. (2006) Data -driven modelling of signal-transduction networks, Nature reviews. Molecular cell biology, 7, 820-828. 课后作业和讨论：讨论网络技术在生物信息学研究中的必要性和局限性。 （四）生物信息学的具体应用（教师课堂教学学时（4 小时） + 学生课后 学习学时（8 小时）） 教学内容：介绍生物信息学在人类健康、农业等方面的具体应用以及最 新进展。 课后文献阅读：Vidal, M., Cusick, M.E. and Barabasi, A.L. (2011) Interactome networks and human disease, Cell, 144, 986-998. 课后作业和讨论：讨论我国应当如何更好的基于国情，开展相应的生物 信息学研究。 十、教学参考书及文献 教学参考书： 1、《生物信息学：序列与基因组分析 (第二版) 》，科学出版社出版，David Mount 主编； 课外文献阅读： 1、《生物序列分析