实验三 琼脂糖凝胶电泳检测DNA ;实验目的;2. 琼脂糖介质结构均一,含水量大(98-99%),可通过调整琼脂糖的浓度改变孔径的大小,起到分子筛的作用。
琼脂糖凝胶电泳
200bp—50kb(分离范围广、方便)
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。不同DNA的分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带。
;3. 溴化乙锭(EB)是一种吖啶类染料,它在紫外灯照射下能发射荧光,当DNA样品在琼脂糖凝胶中电泳时,琼脂糖凝胶中的EB就插入DNA分碱基对子中形成荧光络合物,使DNA发射的荧光增强几十倍,电泳后就可直接紫外灯照射下检测琼脂糖中的DNA。;器材与试剂;核酸样品
DNA marker DL2000
电泳缓冲液:本实验选用TBE
6×上样缓冲液( Loading buffer ):
4℃贮存。增加样品密度,使样品带颜色,起指示作用。
0.25% 溴酚蓝、0.25% 二甲苯青FF、30% 甘油水溶液
10mg/ml 溴化乙锭(EB):贮存液,棕色瓶室温保存。终浓度是0.5μg/ml。
;操作步骤;2、胶床准备:
①取出洗净并晒干的胶床和梳子
②将梳子垂直插入到胶床的小凹槽内,梳齿底端和床面有1mm的间隙。
③将胶床放在调整好的水平台上。;3、铺胶:将冷却致60℃的凝胶倒入准备好的胶床内,凝胶厚度3~5mm。;7、样品准备:向核酸样品中加入约为样品体积1/6的上样缓冲液,用加样器轻轻混匀。例如,5微升的DNA样品+1微升的上样缓冲液,以此类推。;8、上样:用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中。加样量一般10~30μl。;10、电泳结束后,切断电源,取出凝胶 (手套拿取凝胶)。; 影响迁移率的因素
DNA分子的大小
琼脂糖凝胶的浓度
DNA的构象
所加电压 一般5V/cm
电场方向
染料的存在与否
电泳缓冲液的组成;注意事项
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