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三维定量构效关系（3D-QSAR） 比较分子场分析法 CoMFA 比较分子场分析法 CoMFA 比较分子场分析法 CoMFA 比较分子场分析法 CoMFA 比较分子场分析法 CoMFA 比较分子场分析法 CoMFA CoMSIA LOGO LOGO 三维定量构效关系 （3D-QSAR） CADD 基于机制 基于结构 受体结构（蛋白三维结构已知） 分子对接法 小分子（已知结构和活性） 比较分子场分析法 (CoMFA) 一般研究过程 受体拮抗剂或激动剂 受体的活性部位形状及作用方式 虚拟的受体模型 计算 理论基础 如果1组化合物以同样的方式作用于同一靶点，则其生物活性就取决于每个化合物周围分子场的差别，这种分子场可以反映药物分子和靶点之间的非键相互作用特性。 用分子场研究药物与受体间的相互作用 操作过程 前期准备 1.逐一建造各化合物的分子 2.结构优化 3.研究药物的优势构象 4.计算各原子的电荷密度 操作过程 分子叠合 根据基于公共骨架的叠合、基于能量场的叠合、基于惯性距的叠合、基于药效团的叠合及基于复合物结构的叠合等规则 把优势构象重叠在一个能 包容全部化合物的空间网格 31个甾体化合物的叠合图形 操作过程 选择探针 H2O分子 疏水作用和氢键作用 CH3探针 立体作用 （范德华力力场） H+探针 电性作用 （静电力场） 操作过程 确定QSAR方程 探针每移动一步长，计算其在网格上与各原子相互作用的立体能和静电能 + 生物活性 偏最小二乘法 交叉验证 操作过程 建立等高线 红色 负电性基团 蓝色 正电性基团 绿色 增大基团体积 黄色 减小基团体积 CoMSIA是对CoMFA方法的改进 与CoMFA 相比，CoMSIA 在力场中引入了 与距离有关的高斯函数 静电场 立体场 静电场 立体场 疏水场 氢键供体场 氢键受体场 LOGO