蛋白质的二级结构主要有哪些类型.docVIP

蛋白质的二级结构主要有哪些类型，其特点如何？ 答：α-右手螺旋，β-折叠，无规卷曲，U型回折（β-转角） 1α-右手螺旋 α-螺旋为右手螺旋，每一圈含有3.6个aa残基（或肽平面），每一圈高5.4?，即每一个aa残基上升1.5?，旋转了100度，直径为5 ?，2个二面角（ф,ψ）＝（-570，-480）。维持α-右手螺旋的力量是螺旋内氢键，它产生于一个肽平面的C=O与相邻一圈的在空间上邻近的另一个肽平面的N-H之间，它的方向平行于螺旋轴，每个氢键串起的长度为3.6个肽平面或3.6个aa残基，被氢键串起来的这个环上含有13个原子，故α-右手螺旋也被称为3.613螺旋。Pro破坏α-螺旋。 2β-折叠 肽链在空间的走向为锯齿折叠状，二面角（ф,ψ）＝（-119℃，+113℃）。维持β-折叠的力量是折叠间的氢键，它产生于一个肽平面的C=O与相邻肽链的在空间上邻近的另一个肽平面的 3U型回折：也叫β- 转角，肽链在某处回折1800所形成的结构。这个结构包括的长度为4个aa残基，其中的第三个为Gly，稳定该结构的力量是第一和第四个aa残基之间形成的氢键。 4无规卷曲：无固定的走向，但也不是任意变动的，它的2个二面角（ф,ψ）有个变化范围。 论述 04蛋白质 简述蛋白质一级结构的分析方法。 第一步：前期准备，第二步：肽链的端点测定，第三步：每条肽链aa顺序的测定，第四步：二硫键位置的确定。 ?1第一步：前期准备 ?分离纯化蛋白质：纯度要达到97％以上。 ?蛋白质分子量的测定：用于判断分子的大小，估计肽链的数目，有 渗透压法、 凝胶电泳法（聚丙烯酰胺、SDS）、 凝胶过滤法、 超离心法等 ?aa组成的测定：用于最后核对，氨基酸自动分析仪。 ? 肽链拆分：非共价键的如氢键、离子键、疏水键、范德华力4种，可用尿素或盐酸胍等有机溶液来拆分。共价键的仅二硫键1种，可用 巯基乙醇、碘代乙酸、过甲酸来 拆分。 ?2第二步：肽链的端点测定 ?N端测定： Sanger 法，DNFB→DNP-肽→水解→乙醚萃取→层析鉴定。 ? Edman 法，PITC→PTC-肽→PTH-aa→层析鉴定。 ?C端测定： 肼解法。 ?3第三步：每条肽链aa顺序的测定 事先要将蛋白质打断成多肽甚至寡肽，再上机分析，而且要2套以上， 便于以后拼接。 ?常用的工具酶和特异性试剂有： ? 胰蛋白酶：－（Arg、Lys）↓－。产物为C端Arg、Lys的肽链。 ? 糜蛋白酶：表示为－（Trp、Tyr、Phe）↓－ 。 ? CNBr：－Met↓－。 4第四步： 二硫键位置的确定 包括链内和链间二硫键的位置，用 对角线电泳来测，这项工作在AA序测定完毕后进行。在肽链未拆分的情况下用 胃蛋白酶水解之，可以得到被二硫键连着的多肽 产物。先进行第一向电泳，将产物分开。再用巯基乙醇处理，将二硫键打断。最后进行第二向电泳，条件与第一向电泳完全相同。选取偏离对角线的样品（多肽或寡肽），它们就是含二硫键的片段，上机测aa顺序，根据 已测出的蛋白质的 aa 顺序，把这些片段进行定位，就能找到二硫键的位置。 以B-DNA和tRNA为例叙述核酸的二级结构模型。 答：一．Watson-Creck的DNA二级结构模型（B-DNA，线状DNA，自然选择）: 美国Watson 、英国Creck提出： 1DNA分子是由2条DNA单链互相缠绕而成，2条链反向平行（一条链为5’→ 3’，另一条链为 3’→ 22条链靠链间的H键结合，H键的产生于碱基之间，符合碱基配对原则：A＝T，G＝C。右手螺旋的维持力主要是碱基堆积力，其次是氢键。 3DNA的骨架为磷酸和脱氧核糖，在分子外面，戊糖平面∥螺旋轴，DNA的侧链基团是碱基，在分子内部，碱基平面⊥螺旋轴。螺距34?，直径20?，10bp/圈。分子有一条宽沟称为大沟，还有一条窄沟叫小沟，复制和转录的有关酶就是付在大沟之处的。 4遗传信息储存在DNA分子的bp序中。 5意义：能够解释DNA的一切物理化学性质；实现了DNA的结构与生物功能之间的统一：精确的自我复制。 二. RNA的二级结构模型 RNA的二级结构通式：茎环结构：RNA局部双螺旋，符合A-DNA模型。 tRNA的二级结构模型 三叶草模型： AA臂：其3’ 功能：携带AA 二氢尿嘧啶环：含有二氢尿嘧啶，稀有碱基 反密码环：具有反密码子，可以和mRNA上的密码子配对，将携带的AA送到恰当的位置 额外环：显示tRNA特异性的地方，是tRNA分类的依据。 TψC环：含有稀有碱基T（本应该在DNA中的）、假尿苷ψ 用化学渗透学说阐述氧化磷酸化的机制 1要求线粒体的内膜封闭完好，呼吸链中的电子载体和质子载