质谱数据定量分析方法【通用】.pptVIP

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  • 2020-05-13 发布于湖北
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定量信息提取:标记定量 图谱水平: 非线性拟合算法 特点 可定义一般模式,支持自定义标记方法,支持多重标记 能够充分利用同位素分布信息 能够直接解决谱峰叠加问题 * 定量信息提取:标记定量 肽段水平 实现了多种算法:XIC面积比, 图谱比值平均,主成分分析, 最小二乘回归 采用了异常值排除策略 实现了基于XIC连续性的截断 * 单一同位素峰最高 问题:同位素峰分布测量误差 第二同位素峰最高 第三同位素峰最高 第四同位素峰最高 数据:FT_yeast, BPRC,高可信鉴定肽段 * 问题:从质量预测同位素分布 经验公式:从IPI.Human 3.49酶切肽段中统计(胰酶,2个漏切,肽段长度不超过100) ai bi 1.007 0.0005792 0.0006321 -0.09212 0.0005683 0.02292 0.0005526 0.09675 0.000568 0.1138 0.0005795 0.1215 Bellew, M., M. Coram, et al., Bioinformatics, 2006. 22(15):. * 重复实验的数据处理 RT对齐和交叉搜索 P1 P2 Pn … √ X X √ √ √ MS搜索 MS搜索 信息的充分利用 不可逆:需要建立 个RT对齐模型 可逆:需要建立n-1个模型 工作:实现了基于

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