分子生物学 第二章 2-基因的分子结构.pptVIP

1. 超螺旋（superhelix OR supercoil） ●?最早在SV40和多瘤病毒中发现 ● 超螺旋是所有线性或环形DNA的共有的重要特征 超 螺 旋 形 成 示 意 末端固定的线型双螺旋 额外的张力不能释放 双螺旋以扭曲方式缓 解应力，形成超螺旋 L 连接数（Linking number ） 双链DNA的交叉数， 不发生链断裂时，L为定值 T 盘绕数（Twisting number ） 双链DNA的缠绕数，初级螺旋圈数 W 超盘绕数（Writhing number） 直观上为双螺旋在空间的转动数 W= 负值（negative superhelix） W = 正值 ( positive superhelix） 超螺旋发生的规律 l B-DNA是力学上稳定的结构（ 10 bp/ helix） l? 虽交叉数减少，但需转换为一种应力，以维持10bp/helix的螺旋数， l? 应力的重新分配 或在B-DNA状态中保留一单链区 或螺旋力将维持B-DNA的右旋结构, 形成超螺旋 420bp L=42 T=42 W=0 无应力松弛状态 应力的分配 L = 36 T = 36 W = 0 L = 36 T = 42 W = -6 链松弛后再结成环 链未松弛再结成环 松开6圈螺旋 △L = －6 ??＊ ? DNA在水溶液中, 构型偏B型状态 ＊? DNA以10.5 bp/helix为最稳定构型 ＊ 小于10.5bp/helix 向正超螺旋发展(紧缩态) ＊ 大于10.5bp/helix 向负超螺旋发展(松弛态) 天然的DNA都是负超螺旋 但一些生命活动过程中存在正超螺旋 B-DNA的变化情况： ※ T.S. DNA的类型 PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA ● D.S. DNA + D.S.DNA T.S. DNA + S.S. DNA 2. 三螺旋DNA ● Homologous palindromic sequence in a D. S. DNA (mirror image structure) ----TTCCCTCTTTCCC------CCCTTTCTCCCTT--- ----AAGGGAGAAAGGG---GGGAAAGAGGGAA-- Mirkin (1987) pGG332 plasmid DNA --------TTCCCTCTTTCCC-------- --------AAGGGAGAAAGGG-------- -------TTCCCTCTTTCCC--------- --------AAGGGAGAAAGGG------- Nodule DNA Hinged DNA free DNA 三股螺旋DNA结构特点总结 第三条单链DNA分子位于B-DNA大沟内 碱基之间靠 Hoogsteen 键连接 无论何种形式的三螺旋 DNA, 第二股中间 链必须是 Purin链 第三股链至少长于8 dNt 真核生物基因组内, 约1%左右的序列为 大于100 bp 的homologous cluster (重复序列与调控序列) T. S. DNA多存在于其中 T. S. DNA可能的功能 可阻止调节蛋白与 DNA结合, 关闭基因转录过程 micro－RNA Epigenetic! b) 与基因重组, 交换有关 加入第三条S. S. DNA 作为分子剪刀 (molecular scissors) 定点切割DNA分子 加入反义的第三条链(anti-sence polydNt) 终止基因的表达 3. 四股螺旋DNA ( tetraplex DNA, Tetrable Helix DNA ) 发现 ?????? 1958. Poly(G) X-ray photograph? 碱基形成环