医学分子生物学新技术应用.pptxVIP

分子生物学新技术及其应用申志发E-mail：shenzhifa @ Tel662693 （短号）温州医科大学检验医学院/生命科学院教育部检验医学重点实验室代谢组学及研究技术microRNA的研究及应用免疫共沉淀技术（Co-Immunoprecipitation）4.胞内RNA分子可视技术第一节 代谢组学及其研究进展什么是代谢组学？代谢组学研究方法代谢组学分析技术气相色谱-质谱联用技术（GC-MS）液相色谱-质谱联用技术（LC-MS）毛细管电泳-质谱联用技术（CE-MS）核磁共振技术（NMR）代谢组学研究什么？？环境变化特定基因突变代谢组学研究对象生物体系生物体系（细胞、组织或生物体）代谢产物发生变化（种类，随时间变化）水 消化吸收 脂类 糖类 无机盐中间代谢蛋白质维生素废物排泄体内各种物质代谢过程互相联系形成一个整体 各种物质代谢之间互有联系，相互依存。机体物质代谢不断受到精细调节内外环境的变化对机体代谢造成影响精细的调节控制机体有精细的调节机制，调节代谢的强度、方向和速度适应环境的变化 代谢组(metabolome)是指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同化学型的分子, 比如肽、碳水化合物、脂类、核酸以及异源物质的催化产物等。代谢组学(metabonomics／metabolomics)来源于代谢组一词,是研究一个细胞、组织或器官中所有小分子代谢组分集合的科学。代谢组学研究的目的是定量分析一个生物系统内所有代谢物的含量。 代谢组学分析可以指示细胞、组织或器官的生化状态, 协助阐释新基因或未知功能基因的功能, 并且可以揭示生物各代谢网络间的关联性, 帮助人们更系统地认识生物体。进行代谢组学研究涉及生命科学、分析科学以及化学统计学三大方面的专业知识。 代谢物化学分析技术及数据分析技术的发展极大促进了诸多生物、医学问题的研究, 这些知识的综合运用使得代谢组研究在疾病诊断、药理研究以及临床前毒理等研究中发挥了极为重要的作用。普遍定义代谢组学：通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或环境变化后），其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。研究对象：相对分子质量小于1000的内源性小分子。代谢物小分子类别：多肽、氨基酸及其衍生物、胺、脂类、金属离子。特点1.关注于内源性小分子化合物。2.对生物体系中的小分子化合物进行定性定量研究3.内源性小分子化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响。4.内源性化合物的特点用来表征疾病和药物筛选。Van De Greef: publication of MS for urine profiling1982Sadler, Buckingham and Nicholson: First publication on 1H-NMR of blood and plasma1983Nicholson, et al.: Multi-component analysis of spectra data from rat urine1984Nicholson and Wilson: NMR spectroscopy of biofluids1989Nicholson: Definition of Metabonomics1999Haselden, et al.: First independent Pharma publication of Metabonomics2000Nicholson, Lindon, and Holmes: Publication in Nature on Metabonomics2001Holmes and Antti Explanation of statistics in Metabonomics2002Increasing # of publications2007代谢组学的发展研究方法生物组织，体液经灭活预处理多个方法联用Zhejiang Provincial Key Lab of Medical Genetics研究步骤：应用药物研发疾病研究植物代谢组学微生物代谢组学中药现代化一些有用的数据库：连接图数据库 Connections Map DB京都基因与基因组百科全书 KEGG (http://www.genome.jp/kegg/ligand.htmlhttp://www.genome.jp/kegg/ligand.html)生物化学途径 ExPASy互联网主要代谢途径 main metabolic pathways on Internert, MMPDuke 博士植物化学和民族植物学数据库Arizona 大学天然数据库Wiley_handbook of