PDB数据库简介复习.pptVIP

二、简单使用 搜索栏 高级搜索 * 搜索到408条结果 精化搜索结果 检索CDK2 * 相关介绍 下载氨基酸序列及 二级结构的信息 分辨率不同 配体不同 * PDB数据库文件 包括分子类别、发布日期，PDB-ID 关键字列表 测定结构所用的试验方法 * 以关键字SEQRES打头 306个氨基酸的显式序列信息 * X轴坐标 Y轴坐标 Z轴坐标 原子 氨基酸 * PDB数据库的详细字段说明 HEADER 分子类，公布日期，ID号 OBSLTE 注明该ID号已改为新号 TITLE 说明试验方法类型 CAVEAT 可能的错误提示 COMPND 化合物分子组成 SOURCE 化合物来源 KEYWDS 关键词 EXPDTA 测定结构所用的实验方法 * PDB数据库的详细字段说明 AUTHOR 结构测定者 REVDAT 修订日期及相关内容 SPRSDE 已撤销或更改的相关记录 JRNL 发表坐标集的文献 REMARK 1 有关文献 REMARK 2 最大分辨率 REMARK 3 用到的程序和统计方法 REMARK 4 其他注解 DBREF 其他序列库的有关记录 SEQADV PDB与其它记录的出入 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * PDB数据库简介 * 生物数据库的种类 * 生物数据库的种类 序列数据库 核酸序列数据库 (EMBL、Ge