睡莲类植物ITSnrDNA序列的分子系统发育分析.docVIP

收稿日期:2002-05-28 基金项目:湖北省地球表层系统开放实验室资助项目. 睡莲类植物ITS nrD NA 序列的分子系统发育分析 唐先华1, 张晓艳2, 施苏华3, 钟　扬2, 赖旭龙1 (1. 中国地质大学地球科学学院, 湖北武汉430074;2. 复旦大学生物多样性科学研究所, 上海200433; 3. 中山大学生命科学学院, 广东广州510275 摘要:. 区是核 核糖体(nrDNA 转录单位的一部分. 测定和分析了57ITS 序列, 并与G enBank , 2个ITS 系统树, . 关键词:睡莲类; ITS . 中图分类号:A :-2003 -0097-05 (- , 女, 博士研究生, 主要研究方向为分子古生物学. E 2mail :@ 　　当前应用DNA 分子研究古生物及演化生物学问题的2个主要范畴之一是:利用现代生物的DNA 序列间接地讨论古生物学问题[1]. 在研究某一个生物类群时, 根据现代生物DNA 序列建立的系统树可被用于对比以化石资料为依据所建立的系统关系. 对所测定的古代DNA 序列一般要输入计算机中同其他同源的古代及现代DNA 序列进行对比以确定其 来源, 并运用现生生物基因库资料分析古DNA 序列, 用于讨论古生物学问题. 因此, 现代生物分子研究是分子古生物研究的必要基础, 每一例分子古生物研究都必须以某个分子生物学结果作为原始数据. 同时, 现代生物分子中蕴藏着大量历史信息, 分子系统学据此进行系统分类和谱系重建[2]. 被子植物的起源是科学界普遍关心的热点问题. Qiu 等[3]用5个线粒体、质体、核苷酸基因进行系统发育分析, 支持AN ITA (A m borella 、Nymphaeales 、Illiciales 2Trimeniaceae 2A ust robaileya 代表被子植物 进化的最初阶段, A m borella 是所有其他被子植物的姊妹群(sister group . 并且来自早白垩纪花的结构化石也表明和AN ITA 有相似之处. Mathews 等[4]用细胞色素基因(PHYA 和PHYC DNA 序列分析得出相同的结论. 另外,Barkman 等[5]研究得出A m borella 和Nymphaeales 的组合是被子植物谱系的最早分支. 可见, 睡莲科及其相关莲科, 水盾草科和金鱼藻科等, 仍然是目前植物分子系统学与进化研究的一个重要类群. 睡莲类植物, 或称广义睡莲目(Nymphaeales sen 2su lato , 是原始双子叶植物中的一个重要类群, 包括10属约110余种, 广泛分布于世界温带、亚热带和热 带地区. 我国有分布或栽培记录的7属是莲属 (Nel um bo Adans. 、睡莲属(N ym phaea L. 、芡实属(Euryale Salisb. 、萍蓬草属(N uphar Sm. 、莼菜属(B rasenia Schreb. 、王莲属(V ictoria Lindl. 和金鱼藻属(Ceratophyll um L. . 其他3属是O ndi nea Den Hartog , Cabom ba Aubl. 和B arclaya Wall. [6～8]. 虽然 人们对该类植物已有较长栽培和研究历史, 但对其分类系统及属间关系一直争议颇多. 核基因组的ITS 区位于18S 和26S rRNA 基因之间, 被5. 8S rRNA 基因分为两段, 即ITS -1和 ITS -2[9], 是核核糖体(nrDNA 转录单位的一部分, 在被子植物中, ITS 区具有长度保守性和核苷酸序列的高度变异性, 使得这些间隔区的DNA 序列较为容易排序, 而高度变异性可以为重建较低分类阶元的系统发育提供分子证据[10,11]. 本实验将选取 7种睡莲类植物, 运用手工测序和自动测序法, 测定 第28卷第1期 地球科学———中国地质大学学报 Vol. 28　No. 12003年1月 Earth Science —Journal of China University of G eosciences Jan. 　2003 表1　实验材料的种名、缩写及来源 Table 1 Species , abbreviation and source 种名 缩写 来源登录号/长度 Nel umbo nucif era cv. NNU1中科院武汉植物所 AF136289/626bp Nel umbo nucif era cv. NNU2中科院武汉植物所AF136290/637bp Ny m phaea alba NAL 中科院武汉植物所AF136285/644bp Ny m phaea mexicana NME 中科院武汉植物所AF136286/645bp N