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字符集合 只是一些非控制型字符，象空格和结束符，出现在 PDB 文件记录中。也就是： abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ 1234567890 ` - = [ ] \ ; , . / ~ ! @ # $ % ^ * ( ) _ + { } | : ? 空格和结束符。结束符根据 统而定，Unix 用一行字符，而其他的 统可能就用一个回车来表示。 特殊字符 希腊字母就详细的拼写出来。比如：α, β, γ 原子用 DOT 表示。 右箭头用--表示。 左箭头用--表示。 上标用两个等号表示开始和结束。比如：S＝＝2+ ＝＝ 下标用一个等号来表示开始和结束。比如：F=c= 如果等号两边至少有一边有一个空格，那么这个字符就是表示等号。比如：2 + 4 = 6 逗号，冒号和括号用来表示文档中的分界苻，也就是下面几种中的一种： List SList Specification List Specification 如果逗号，冒号或者括号在任何一片文档中使用不是作为分界苻的话，那么肯定有字符被漏掉了。比如下 边例子中第四行的\ ： COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: GLUTATHIONE SYNTHETASE; COMPND 3 CHAIN: NULL; COMPND 4 SYNONYM: GAMMA-L-GLUTAMYL-L-CYSTEINE\:GLYCINE LIGASE COMPND 5 (ADP-FORMING); COMPND 6 EC: 6.3.2.3; COMPND 7 ENGINEERED: YES COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: S-ADENOSYLMETHIONINE SYNTHETASE; COMPND 3 CHAIN: A, B; COMPND 4 SYNONYM: MAT, ATP\:L-METHIONINE S-ADENOSYLTRANSFERASE; COMPND 5 EC: 2.5.1.6; COMPND 6 ENGINEERED: YES; COMPND 7 BIOLOGICAL_UNIT: TETRAMER; COMPND 8 OTHER_DETAILS: TETRAGONAL MODIFICATION 数据类型 该部分该部分主要用来描述试验和记录中该大分子的一些基本信息,有 以下几种记录: HEADER,OBSLTE,TITTITLE,CAVEAT,COMPND,SOURCE,KEYWDS,EXPDTA, AUTHOR,REVDAT,SPRSDE,JRNL 和 REMARK 部分。以下来具体说明一下各个记录。 记录类型 按照在记录中出现的频率区分: SINGLE 一个文件中只出现一次.按字母顺序列出如下: 记录类型 说明 CRYST1 晶胞参数 END 结束 HEADER 分子类，公布日期，ID 号 MASTER 版权拥有者 ORIGXn 直角－PDB 坐标 SCALEn 直角部分结晶学坐标 如果这些记录在一个记录中重复出现是错误的。 SINGLE CONTINUED 在记录中概念性的只出现一次,但信息内容可能超过了可利用列的数目.因次这些记录在后来的排列中会 继续.按字母顺序列出如下: 记录类型 说明 AUTHOR 结构测定者 CAVEAT 可能的错误提示 COMPND 化合物名称 EXPDTA 测定结构所用的试验方法 KEYWDS 关键词 OBSLTE 注明该 id 号已改为新号 SOURCE 化合物来源 SPRSDE 已撤消或更改的相关记录 TITLE 说明试验方法类型 MULTIPLE 大部分记录类型多次出现,经常出现在这些组中,组中的信息理论上并没有连接,但已呈现为列表的组成部 分.这种记录类型中的许多习惯连载可能不仅仅制定记录还和其他记录相联.按字母顺序列出如