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猪链球菌暴发疫情 ? 2005 年 - 四川人感染猪 链球菌暴发疫情 ? 215 人感染、 39 人死亡 ? 波及四川 36 个县的 202 个村庄 ? 重庆， 贵州， 广东， 江西也发现病例 ? 江苏 1998 暴发疫情 ? 25 感染 /14 死亡 Yu, H., H. Jing, Z. Chen, et al. 2006. Human Streptococcus suis outbreak, 四川 , China. Emerg.Infect.Dis. 12:914-920 31 ppt 课件 中国猪链球菌 PFGE 型别 ? Sma I 酶切： ST7 型分为单一的 PFGE-01 型 ? 2005 ， 2006 年和 2007 年中国 ST7 菌株： PFGE-01 型 Ye, et al. 2006. Emerg.Infect.Dis. 32 ppt 课件 cod e Locus § Location in GZ1 Matches In GZ1 % Tandem repeat sequence Tm ℃ Simpson s index % ? TR1 SSTR135_111bp_445_3u 135784..136228 64 CGTTAAGCAAATCCTAGACAAAATAGGAAATCGAAGCAGATAGCTTCAATCAAGGAGATTT ATCTTTTTGCCAGAATTTGTAGCTCGAATTCAACTAAGATTAAGATAGAGGA 60 4.7 TR2 SSTR218_39bp_210_2.7u 218682..218891 94 AGCAGCCTGTAGTTGAGGCACCTGTAGAGGAAGTTGTAG 58 8.2 TR3 SSTR1675_102bp_287_2u 1675611..16758 97 88 CAAGAAAAAATGGTCCATTCTCGCCGTTGCGCCTTTCCAGTTTCTTGGGCG 60 5.9 TR4 SSTR1260_90bp_928_7u 1259913.. 260840 84 ATATTGAAACCTCTGAAAAACAGATGCCAAGTATTGTGAACGACAATGTCGTAACACCTGA AAAGCAAATGGCTAATAAAGAGAACGATA 55 8.3 TR5 SSTR69_49bp_352_2u 69283..69634 89 AAGGTCCGGTGGACCTTTTTATCATGAGCATGAAAACAAGAAAGCGAATT 60 5.9 TR6 SSTR928_30bp_172_2u 927971..928142 100 CGTTGCTGGTACCGTAGCAGTTGCATCAGT 60 7.0 TR7 SSTR127_10bp_134_4u 127866..127999 96 AAAATATAGA 58 7.1 TR8 SSTR260_231bp_677_2u 260573..261249 80 CCAGAAGAGCCAAAACAAGACGCTCCACAAGCGCCATCAACACCGGAAAAACAAACAGAA GAACCGAACAAGGAAGAACCTAAGAAAACACCACAAGCGCCATCGACTCCGGAA AAACAACCAGAAGTACCGGAATCACCAAACCCAGAGACACCAGACGCGCCATCGA CTCCAAAAGATGAACCGCAAGCTCCATCAATCCCAGAAGAAAAACCAAAAGTA 55 22.7 TR9 SSTR709_5bp_354_38u 709802..710155 100 GAGCA 58 96.1 猪链球菌 MLVA 指标和特征 上游引物标记： FAM / HEX/ TAMRA. 多重 PCRs M1 和 M2 用毛细管电泳 M3 用普通电泳法 TR1~8 低或中等变异度指标 TR9 高变异度指标 (value 0.96). 33 ppt 课件 指标的等位基因型 34 ppt 课件 166 株 猪链球菌血清 2 型 的 MLVA 分型 35 ppt 课件 36 ppt 课件 多位点可变数目串联重复序列 （ MLVA ）分型技术和操作步骤 李 伟 中国 CDC 传染病所 传染病预防控制国家重点实验室 PulseNet China 第一期培训 2010-06-19 1 ppt 课件 病原菌分子分型的目的 ? 长期研究 病原菌的遗传进化 – 病原菌适应来自宿主的高选择性压力 – 因点突变、重组（包括基因转移）等遗传变异 ? 短期研究 – 了解病原菌的适应性 – 感染溯源 2 ppt 课件 分子分型方法 ? 序列或分类资料为基础的等位基因
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