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- 2020-08-15 发布于天津
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WB 实验细节详述 时间: 2016-05-07 一:蛋白定量(实验前处理) ? 组织:到手的组织状态:冰袋快递:组织腐烂,蛋白含量减少 干冰快递:基本无影响 甲醛处理:石蜡包埋组织蛋白提取试剂盒 需用匀浆器,液氮等方法加入 1*PBS 充分研磨 裂解液量:组织( g ):裂解液( ml ) =1:10 细胞:一般为细胞悬液实验前需确定细胞大概浓度 裂解液量: 10 7 数量细胞加入 1ml 裂解液 一:蛋白定量(裂解液详述) 裂解液使用时加入 PMSF : 1ml 裂解液加 1ulPMSF PMSF (苯甲基磺酰氟)是一种蛋白酶抑制剂,可抑制丝氨酸蛋白酶(如胰蛋白酶,胰凝 乳蛋白酶,凝血酶)和巯基蛋白酶(如木瓜蛋白酶) PMSF 在水液体溶液中不稳定,见水易分解,需使用前加入。 RIPA 裂解液: ( 100ml 体系) 试剂名称 配方 作用 Tris (pH 7.4) 50mM 生物缓冲液 NaCl 150mM 让蛋白处于正常条件下,避免蛋白构象改变 Triton X-100 中性去垢剂 1% 保持蛋白天然构象,提高细胞膜的通透性 sodium deoxycholate ( 脱 氧胆酸钠 )阴离子去垢剂 1% 裂解细胞,溶解蛋白(尤其是难溶于水的膜蛋 白) SDS 阴离子去垢剂 0.1% 破坏蛋白分子的二、三级结构使分子被解聚成 多肽链,解聚后的氨基酸侧链和 SDS 结合成蛋 白 - SDS 胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白 原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电 荷差异和结构差异。 一:蛋白定量(原理) ? 在碱性环境下蛋白质与 Cu 2+ 络合并将 Cu 2+ 还原成 Cu 1+ 。 BCA 与 Cu 1+ 结合形成稳定的紫蓝色复合物,在 562 nm 处有高的 光吸收值并与蛋白质浓度成正比,据此制作标准曲线做对 比,即可计算待测蛋白的浓度。 一:蛋白定量(实验过程) ? 加标样 + 水(共 10ul ) 样品 5ul+ 水 5ul ? 混匀放置 37 ℃培养 30min, 测 OD 值, 562nm 标样 (ul) 0 1 2 4 6 8 10 水 (ul) 10 9 8 6 4 2 0 加入 200ul ( A+B) 工作液, A 液: B 液 =50:1 一:蛋白定量(数据处理) OD 蛋白浓度( ug/ul ) 最大上样量为 35ul 蛋白浓度 30ug 保证每个孔蛋白量相同 二: 聚丙烯酰胺凝胶电泳(配胶) ? 分离胶 试剂 分离胶浓度 6% 8% 10% 12% 15% 18% 分子量( kDa) ≥94 70-94 55-70 20-55 10-20 ≤ 10 去离子水( ml ) 5.3 4.6 4.0 3.3 2.3 1.3 30 %丙烯酰胺( ml ) 2 2.7 3.3 4.0 5.0 6.0 1.5MTris - HCl ( PH8.8 )( ml ) 2.5 2.5 2.5 2.5 2.5 2.5 10 % SDS ( ml ) 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 10 % AP ( ml ) 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 TEMED ( ul ) 0.008 0.006 0.004 0.004 0.004 0.004 总体积( ml ) 10ml (两块胶的量) 作用:使蛋白样品分离 对于分离胶来说, pH8.8 与甘氨酸的 pka 接近,从而使不同分子量的蛋白产生不 同的泳动速度,从而使不同分子量的蛋白分开。 二: 聚丙烯酰胺凝胶电泳(配胶) ? 浓缩胶 作用:使蛋白样品浓缩 对于浓缩胶来说, pH6.8 可以 通过甘氨酸和和氯离子的作 用产生压缩,从而使蛋白条 带压细。 试剂 浓缩胶浓度 5% 水( ml ) 2 30 %丙烯酰胺( ml ) 0.5 1.0MTris - HCl ( PH6.8 ) (ml) 0.38 10 % SDS ( ml ) 0.03 10 % AP ( ml ) 0.03 TEMED ( ul ) 0.03 总体积( ml ) 3 (两块胶的量) ? 制分离胶时 10%AP 加入后迅速混匀再加 TEMED 制胶,沿壁灌注,灌 注时尽量不要产生气泡,如有气泡,用移液器将气泡吸出,留出浓缩 胶所需空间(梳齿长再加 1cm )。 ? 覆盖水层于分离胶溶液上,夏天将制胶器放室温 20min ,冬天放 37 度 培养箱 20min-30min ? 待分离胶和水层之间会出现清晰界面,表明分离胶充分聚合(可微微 倾斜模具,检测凝胶是否聚合),倒掉并用滤纸吸干水 ? 在已聚合分离胶上直接灌注浓缩胶液体,立即插入加样梳(缓慢插入, 避免产生气泡)。将凝胶在室温或者 37 ℃静置 20-30min (视具体情 况而定),直到浓缩
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