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单细胞测序技术大 PK 随着“人类细胞图谱”计划的开展，单细胞测序技术已经进入 2.0 时代，尤 其，基于微液滴或者微流控芯片技术的高通量单细胞分选平台的出现， 引领生命 科学研究进入单细胞生物学时代。 目前，国内外以及各种文献报道的单细胞测序技术让人眼花缭乱， 不知该如 何选择。其实，国内外大规模单细胞技术的平台主要有 C1?单细胞全自动制备系 统、 ICELL8 Single-Cell System 、 Illumina?Bio-Rad?Single-Cell Sequencing Solution 、 BD Rhapsody? Single-Cell Analysis System 和 10X Chromium Single Cell Gene Expression Solution 这五种，接下来小编就带你一一了解下： 10X GENOMICS技术简介 ChromiumTM Single Cell 3 ′ Solution 是基于 10 X Genomics 平台，能够一次性分离、并 标记 500 –10000 个单细胞，并能在单细胞水平进行检测的技术，其通过微流控系统，将单 细胞或长片段 DNA 分子快速分配到油包水的微反应体系中， 每个微反应体系中的单 DNA 分 子会获得唯一的特异性分子标签，制备生成的测序文库可以在 illumina 平台进行测序，并由 10x Genomics 提供数据分析及可视化软件， 测序实验及分析流程可以和 illumina 系统无缝衔 接。 10×genomics 技术一次可以同时得到大量大细胞数据， 但只能得到 mRNA 信息，LncRNA 大部分信息丢失， UMI 技术能很好去除认为分析引入 duplication 及 PCR引入 SNP位点。同 样对 RNA 质量要求高，降解同样会引起 5 ’端信息丢失。 10X GENOMICS单细胞转录组测序优缺点 10x Genomics单细胞转录组测序优点 1、简单便捷：集单细胞分选、扩增、建库于一体； 2、细胞通量高：每个样本细胞数可达 500-10000 个； 3、建库周期短： 1 天可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库； 4、超高捕获效率：单细胞捕获效率高达 65%； 5、真正意义的单细胞：单个液滴捕获到多个细胞的概率极低（ 0.9%/1000cells ）； 6、价格实惠：相较于其它单细胞平台，价格实惠。 10x Genomics单细胞转录组测序缺点 1、非全长信息：只能获得 3 ’端转录本信息； 2、样本要求高：单个样本细胞起始量达 10^5-10^6 个，活细胞数目需超过 80%，建议 在 90% 以上最佳。 BD Rhapsody? Single -Cell Analysis System 该系统采用分子标签技术，能为单细胞中每个转录本标记特异性分子标签， 实现了单细胞水平上基因表达谱的绝对定量， 同时，每个细胞也会被标记特异性 细胞标签， 这使高通量平行建库成为可能。 结合 Rhapsody 特有的单细胞分离技 术，单次实验可制备 100— 10000 个单细胞文库，用户可根据需求定制引物，将 检测范围集中在目标基因，大幅降低后续测序成本。 优势： 实现多样