分子生物学常的用软件介绍.pptVIP

常用分子生物学软件讲解  软件功能分类简介 综合软件: dNAsis2.50miga2.0 DNA tools5 Bioedit dnassist 同源分析: Promised2 Genetree genedoc3.2 Kest 1 Clastal x 引物设计: Primer premier5.0 oligo6.0 DNAc lub 质粒绘图: Gene contruction kit2.0 Plasmid Premi 2.0 Winplas 2.6 图象观察: Vector nti viewer/(n3d/ Pov-Ray// Molmol 2. 5//BandLeader//RasMol 2.7 统计分析: Dnasis2:5 Antheprot macaw205  实验准备阶段 般要査一些与实验相关的文献,以便对自己所 要做课题的最新进展有一个基本的了解,从而确定自 己的实验策略。较常使用软件: Reference manager9.0  Reference Manager 9.0 可以在线通过查找关键词搜索 PubMed和609个 Z3950数据库中的专业资料,同时保存査找的资料 为本地文件。 资料内容和记录分上下两个屏幕,如有全文或想 连接网络时敲键盘就可到相应的全文文章和摘要。 可以直接在WORD中查找资料,并插入引用。在 文章中对引用的文献可以格式化,引用的参考资 料格式有很强的用户自定义功能,可以符合各种 杂志对引用格式的要求,引用时不用多窗口切换  2.Endnote3 1.2 是一个在线专业资料査找系统可以保存查找资料,并 在文章中对引用格式化  实验实施阶段 随着实验的进行,就必须对实验过程中的DNA RNA和蛋白质的信息进行各种处理,包括限制酶分析 引物设计、同源序列比较、质粒作图、结构域(moi 查找、RNA二级结构预测、蛋白二级结构分析、三维 结构显示等方面的内容。  |、综合软件 Omiga2.0 | Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件,它 还兼有引物设计的功能。主要功能:编辑、浏 览、蛋白质或核酸序列,分析序列组成。 用 Clustal.w进行同源序列比较,发现同源区 査找核酸限制性酶切位点、基元( Motif)及开 放阅读框(ORF),设计并评估PCR、测序引 物。查找蛋白质解蛋白位点( Proteolytic sies)、基元、二级结构等。 查寻结果可以以图谱及表格显示,表格设有多 种分类显示形式。 另外,该软件还提供了一个很有特色的类似于 L核酸限制酶分析的蛋白分析,对蛋白进行有关」  DNASIS 2.5 DNASIS for windows25版是日立软件公司 I( Hitachi Sofeware Engineering Co., Ltd )974 推出的一个功能强大的序列分析软件。 包含有大部分分子生物学软件的常用功能, 可进行DNA、RNA、蛋白质序列的编辑和分 析,甚至还能进行质粒作图、数据库査询等 功能,足可满足一般实验室的要求 在DOS时代, DNASIS7等版本便是流传甚广 并曾给过许多人以帮助的分子生物学软件, 因此我们有理由期待win版的 BASIS会带给 我们惊喜  DNATools 5.1 与 Omiga, dNASis, PCgene等属于同一类的综合 性软件操作简单功能多 DNATools设计的用户友好、强大,快速、方 便地获取、贮藏和分析序列及数据库査询获得 的序列相关信息。 DNATools包容性很好,能把几乎所有文本文 件打开作为序列。当程序不能辨别序列的格式 时(通过寻找常用序列格式的特征),会显示 这个文件的文本形式,以便你编辑生成正确的 蛋白质或BNA序列,编辑后可以再被载入程  DNATools 若你的序列是 DNAToOls格式时(DNA或寡核 苷酸序列),程序不加注解的载入序列,程 序模式调整成可以接受载入的数据类型(蛋 白质、DNA和寡核苷酸引物序列)。在一个 项目中可以加入几千个序列或引物,并在整 个项目中分析这些序列及标题。这个程序的 个特点是给每个序列或引物添加文本标题 这样就可以用自定义的标题识别序列,而不 必通过它们的文件名。