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综合序列分析软件 Bioedit 2003级高芳銮  Bioedit简介 Bioedit是一个性能优良的免费的生物序列编 辑器,可在 Windows95/98NT/2000中运行, 它的基本功能是提供蛋白质、核酸序列的编 辑、排列、处理和分析。 与 DNAMAN相比,其分析内容相对丰富一些 而且提供了很多网络程序的分析界面和接口 与 DNAMAN等软件配合使用更好 尤其值得一提是利用 Bioedit能够十分方面地 根据指定的核酸序列绘制相应的质粒图谱。  序列的常规操作 序列输入:多种序列输入方式; 序列分类:按标题、位置、定义、参数、注释等分类 成对排列:两序列的最佳排列及计算同一性和类似性; 序列屏蔽:仅采用联配中部分区域进行分析而排除其他 核酸分析:组成、互补、反转、翻译、质粒、限制性内切酶; 蛋白质分析:氨基酸成分、疏水性轮廓、疏水力矩平均数 翻译或反翻译:把DNA或RNA翻译成蛋白质; 切换翻译:在核酸和编码蛋白质序列中切换核苷酸序列; 点图[成对比较]:相互比较两序列的矩阵,生成一个点图  BLAST 本地使用 BLAST o创建本地数据库 o本地 BLAST搜寻 BLAST INTERNET客户端程序 Clustalw 进化分析 使用互联网工具 HTML BLAST网络浏览器 PSI-BLAST nn