蛋白同源建模及分子对接演讲稿.pptVIP

Modeller软件 Modeller是一种用Python语言编写的，可用于本地建立分子模型的软件。然而，很多人并不熟悉Python语言，因此有人编写了一个Moldoller的GUI界面的软件——Easymodeller， Easymodeller科用于简单的单模板建模。目前Modeller最新版本为9.16 Easymodeller 最新版本为4.0。 与在线建模软件相比， Modeller还可进行模型的修饰、多模版建模等操作。 .......... * Easymodeller建模——确定模板 NCBI blast，blastp选择pdb数据库，identity30%模板可用。也可用Swiss-model来寻找合适模板。 .......... * Easymodeller界面 粘贴序列 添加模板，3-10个 建立模型 .......... * 以4e9q.A为模板，建立了CueO的蛋白模型，左图为不含有铜辅基的模型，右图为含有4个铜辅基的模型。 铜离子 .......... * 蛋白模型的检测与评价——以Swiss-model构建的CueO模型为例 Swiss-model构建的CueO的蛋白模型 .......... * SAVE网站评估蛋白模型 .......... * Procheck 红色： 核心区域 黄色： 允许区 浅黄色： 大致允许区 空白： 禁阻区 ...