生物信息学现状与重要究方向.pptVIP

生物信息学 生物信息学 主讲教师:刘吉平 E-MAIL:Liujiping(@scau.edu.cn 艺术设计学院蚕桑分子生物学研究室 亚太地区蚕桑培训中心 2003年2月 生物信息学 概述 二十一世纪是生命科学的时代,也是信息时代 近年来,随着现代分子生物学的发展,特别是 人类基组计划的实施,不断产生出巨量的分子 生物学数据,这些数据有着数量巨大、关系复 杂,以至于不利用计算机根本无法实现数据的 存储和分析。这样,生物信息学最终形成一门 独立的学科并被推上了生物科学发展的最前沿 生物信息学 Bioinformatics:科技界一颗耀眼 的新星 在BIOⅠ NFORMATICS没有诞生之前, 个新药的问世需要十年时间,数亿美 元的RD,而 BIOINFORMATICS已将 这个过程减少三分之二,RD的费用也 相应大大减少。许多中小 BIOTECH公 司也看到了 BIOINFORMATICS的巨大 作用和潜在的商机,纷纷投资 BIOINFORMATICS研究项目。 生物信息学 美国电脑执照-高薪阶层 ·“ BIOINFORMATICS CERTIFICATION”, 这是目前最新的一门生物化学工程与电脑技术 相结合的课程 · Visual basic $1195 · Visual c+ $1295 · Bioinformatics $2500 MIT (Massachusettes Institute of Technology) (美国)麻省理工学院: Course:20.0 ls Date:June 24-28,2002 Tuition: $2,500 的第大学 生物信息学 第二讲生物信息学现状和研究方 向 刘吉平 生物信息学 主要内容 1、背景 2、定义 3、现状 1)生物数据库的发展 2)人类基因组计划逐步完成 3)科研文献的增长 4、研究目标 一什么是生物信息学? 生物信息学 Genome informatics is a scientific discipline that encompasses all aspects of genome information acquisition d interpretation 它是一个学科领域,包含着基因组信息的获取、处理、存储、分配、 分析和解释的所有方面 (The U.S. Human Genome Project: The First Five Years FY 1991-1995, by NIH and DOE 从美国的三个国家计划说起:曼哈顿计划;阿婆罗计划; 人类基因组计划 破译人类遗传密码就要读懂由30亿符号组成的100万页 的“天书” 大孝 生物信息学 生物信息学的发展历程 生物信息学自诞生以来,经历了三个阶段 基因组前期的生物信息学:主要是序列分析、 数据库的査询、计算机操作和PC的应用; 基因组年代的生物信息学:主要是基因的寻找、 数据与数据之间的比较、网络相互界面 (Interface) 后基因组年代的生物信息学:主要是数据的挖 掘、表达、数据多样性的分析、相互交叉数据 分布的总结与分析。其研究的内容不仅包括基 因的查寻和同源性分析;而且进一步到基因和 基因组的功能分析,即所谓的功能基因组学研 究 的大 生物信息学 生物信息学及其发展 生物信息学( Bioinformatics)-.用信息科学、计 算机科学、生物数学、比较生物学等学科的观点和方 法对生命的现象及其组成分子(核酸、蛋白等)进行 研究。主要研究生命中物质的组成、进化、结构与功 能的规律、以及这些物质在生命体中能量和信息的交 换或传递。该学科以计算机和生物电子设备为工具, 对生物信息进行提取、储存、加工和分析,用信息理 论技术及生物数学的方法去理解和阐述生物大分子的 存在和生命价值,最终对它们进行各种处理与应用。 通过这些处理和应用,科学家不仅能理解已有的核酸 和蛋白质序列及其功能,而且能更好地着手研究新的 基因和蛋白序列及其功能 的大 计算机运算速度:18个月增长一倍;物信息学 DNA序列数据:14个月增长一倍 DDBJ/EMBL/GenBank database growth 1995/1-2001/1 12.000 10000 ■ErE 6,000 ■ GenBank 6000 4.000 2,000 三Eoa-E9 8885图88888 a 00