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— 生物信息学论文 学院： 生命科学技术学院 专业： 生物科学 班级： 2013 级 老师： 高亚梅 学生： 蔡欣月 学号： 20134083003 欢迎下载 — 链孢霉 GH5-1 及 GH6-3 基因生物信息学分析 蔡欣月（黑龙江八一农垦大学，生命科学技术学院， 2013 级生物科学专业，黑龙江省，大庆市） 【摘要】目的：分析和预测链孢霉菌 GH5-1 和 GH6-3 基因及其编码蛋白质的结构和特征。 方法：利用 NCBI、 CBS和 ExPASy网站中的各种信息分析工具， 并结合 VectorNTIsuite8.0 生物信息分析软件包， 分析预测链孢 霉菌 GH5-1 和 GH6-3 基因并预测该基因编码蛋白结构的特征和功能。结果： GH5-1 基因全长 2006bp, 编码 区具有 390 个氨基酸，在 GenBank 同源序列中，其与 endoglucanase 3 [Neurospora crassa OR74A]基因氨基 酸序列一致性达到 100%，且有 GH5-1 保守域。 GH5-1 蛋白相对分子量预测为 41907.4 ，理论等电点为 5.14 。 预测 GH5-1 编码蛋白 α螺旋 (H ) 、 β折叠 (E )、无规则卷 (L ) 的比例分别是 16.92％、 33.85％、 49.23 ％，2 个 GTPase结构域。 GH5-1 蛋白为亲水蛋白， 无跨膜区， 有信号肽。 GH6-3 基因全长 1914bp, 编码区具有 419 个氨基酸， 在 GenBank 同源序列中， 其与 exoglucanase 3 [Neurospora crassa OR74A]基因氨基酸序列一致性 达到 100%，且有 GH6-3 保守域。 GH6-3 蛋白相对分子量预测为 44839.3 ，理论等电点为 6.51 。预测 GH6-3 编码蛋白 α螺旋 (H ) 、 β折叠 (E )、无规则卷 (L )的比例分别是 29.59 ％、 16.71 ％、 53.75 ％， 1 个 GTPase结 构域。 GH6-3 蛋白为亲水蛋白，有跨膜区，无信号肽。结论：成功预测 GH5-1 和 GH6-3 基因及其编码蛋白 生化及其结构特征，为下一步对其进行克隆和表达奠定基础。 【关键词】链孢霉菌；糖基水解酶家族 5 （GH5-1 ）；糖基水解酶家族 6 （GH6-3 ）生物信息学 链孢霉菌又称脉孢菌、串珠菌、红色面包菌，俗称红霉菌，是食用菌生产中重要的竞争性杂菌之一。 其广泛分布在自然界土壤中和和禾本科植物上， 尤其在玉米芯上极易发生 [1] 。通过空气、 土壤、 腐烂植物、 谷物等进行传播、 在食用菌生产中， 链孢菌和绿菌是生产中最常见的病原菌。 链孢霉在高温高湿条件下最 易发生，是夏季食用菌生产中危害严重的病原菌，该病原菌生活力强、生长迅速、繁殖快、分生孢子多、 易传播，几乎会感染所有熟料栽培的食用菌，并且一旦感染很难彻底消灭，给生产造成较大的经济损失， 严重危害所有食用菌的母种、原种、栽培种，以及香菇、木耳、银耳、银耳、灵芝等熟料菌简 [2] 。目前链 孢霉菌的全基因组序列已经获得，但有关其蛋白和基因的各类研究仍为数较少，本文通过对链孢霉 GH5-1 和 GH6-3 基因及编码蛋白质进行生物信息学分析， 分析其基本生化及结构特征， 为下一步对其