- 1、本文档共58页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
摘 要
大麦(Hordeum vulgare L )是在全世界范围内广泛种植的重要粮食作物。分蘖是影
响大麦产量的重要要素之一,而miRNA 在分蘖发生发展过程中具有重要调控作用。本
课题以大麦分蘖突变体 GSHO1990 和野生型 Bowman 为实验材料,通过高通量测序和
生物信息学鉴定筛选了与大麦分蘖相关的 miRNA ,并开展了初步的功能验证工作。主
要的结果如下:
1. 在两个材料从二叶期到五叶一心期中一共鉴定到 1608 个miRNA 。去除数据冗余
后比对 miRBase 数据库中已知 miRNA 的信息鉴定得到在大麦分蘖节中有 505 个已知
miRNA ,再利用miRDeep 和psRobot 软件鉴定到207 个新的候选miRNA ;
2 .以Log |FC| 1 和FDR 0.01 为筛选条件,在两个材料中筛选出15 个miRNA
在不同发育时期均显著差异表达;根据miRNA 作用的下游靶基因功能筛选到37 个影响
分蘖的候选miRNA ,其中chr4H:400959067..400959145:+ (miR400H )预测的下游靶基
因和分蘖相关,表达趋势一致且是大麦的新miRNA ,确定为进一步功能验证的目标;
3. 以Log|FC|0.5 为条件筛选了13 个基因作为大麦分蘖miRNA 表达检测的候选内
参基因,经过软件geNorm 、Normfinder 和 Bestkeeper 综合分析并验证,确定miR5051
和miR5048a 是研究大麦分蘖相关miRNA 的最佳内参基因;
4. 通过构建miR400H 的过表达载体,进行水稻遗传转化并获得了23 株T0 代水稻
转基因苗;同时进行大麦遗传转化,一共侵染了100 个大麦幼胚,已经有愈伤组织分化
出绿芽。
关键词:大麦;分蘖;miRNA ;转基因;内参基因
I
Abstract
Barley (Hordeum vulgare L) is one of the most important cereal crops in the world. Tiller
is one component of yield for barley and controlled by miRNA. In order to identify
tiller-related miRNAs in barley, low-tillering mutant GSHO1990 and wild type Bowman in
this study were used as experimental materials based on high-throughput sequencing and
bioinformatics prediction. The main results were as follows:
1. From first leaf unfolded stage to five leaf unfolded stage, in total 1608 miRNAs were
identified in two barley materials. And 505 known miRNAs were identified after removing
redundancy and comparing to miRBase database. 207 novel miRNAs were identified under
miRDeep and psRobot software.
2. To set Log|FC|1 and FDR0.01 as conditions, a total of 15 miRNAs significantly
expressed at different developmental stages and the expression trend was unanimous. And
acc
您可能关注的文档
最近下载
- 《俗世奇人》整本书分享交流教学设计.doc
- 幼儿园-家长抱怨、投诉记录表2.doc
- 2024年中考生物模拟试卷(含答案解析).pdf VIP
- 中心静脉压测量技术(2023年中华护理学会团体标准).pptx
- 塔吊拆除安全专项施工方案(编制、审核要点).docx
- 盐城市规展馆3D影院片制作招标文件(定稿)-招标文件.doc
- 2024年学习教育围绕“六项纪律”(政治纪律、组织纪律、廉洁纪律、群众纪律、工作纪律、生活纪律)研讨交流发言稿【2篇】与“廉洁纪律和群众纪律”研讨发言稿【7篇】汇编.docx VIP
- 水利安全生产知识答题全附完整答案.doc
- 河南郑州“7.20”特大暴雨灾害事件—灾害应对处置.pptx
- 小学五年级下册数学期末考试试卷(含答案).docx VIP
文档评论(0)