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- 2020-11-12 发布于山东
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细胞自噬的研究方法
正常培养的细胞自噬活性很低, 不适于观察, 因此, 必须对自噬进行人工干预和调节,经报
道的工具药有:
一、自噬诱导剂
(1)
Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin
:模拟内质网应激
(2)
Carbamazepine/ L-690 ,330/ Lithium Chloride (氯化锂) :IMPase
抑制剂(即 Inositol
monophosphatase ,肌醇单磷酸酶)
Earles 平衡盐溶液:制造饥饿
(4)
N-Acetyl-D-sphingosine
(C2-ceramide
): Class I PI3K Pathway
抑制剂
(5) Rapamycin : mTOR
抑制剂
(6)
Xestospongin B/C : IP3R 阻滞剂
二、自噬抑制剂
(1)
3-Methyladenine
(3-MA ):( Class III PI3K
) hVps34
抑制剂
(2)
Bafilomycin A1
:质子泵抑制剂
(3)
Hydroxychloroquine (羟氯喹): Lysosomal lumen alkalizer
(溶酶体腔碱化剂)
除了选用上述工具药外, 一般还需结合遗传学技术对自噬相关基因进行干预: 包括反义 RNA 干扰技术( Knockdown )、突变株筛选、外源基因导入等。
三、自噬过程进行观察和检测
细胞经诱导或抑制后,需对自噬过程进行观察和检测,常用的策略和技术有:
1、观察自噬体的形成
由于自噬体属于亚细胞结构,普通光镜下看不到,因此,直接观察自噬体需在透射电镜下。
Phagophore 的特征为:新月状或杯状, 双层或多层膜, 有包绕胞浆成分的趋势。 自噬体( AV1 )的特征为:双层或多层膜的液泡状结构,内含胞浆成分,如线粒体、内质网、核糖体等。自
噬溶酶体( AV2 )的特征为:单层膜,胞浆成分已降解。( autophagic vacuole , AV )
2、在荧光显微镜下采用 GFP-LC3 融合蛋白来示踪自噬形成
由于电镜耗时长,不利于监测( Monitoring )自噬形成,人们利用 LC3 在自噬形成过程中发生聚集的现象开发出了此技术。 无自噬时, GFP-LC3 融合蛋白弥散在胞浆中; 自噬形成时,
GFP-LC3 融合蛋白转位至自噬体膜,在荧光显微镜下形成多个明亮的绿色荧光斑点,一个斑点相当于一个自噬体,可以通过计数来评价自噬活性的高低。
3、利用 Western Blot 自噬形成时,胞浆型
检测 LC3-II/I 比值的变化以评价自噬形成
LC3 (即 LC3-I )会酶解掉一小段多肽,转变为(自噬体)膜型(即
LC3-II ),因此, LC3-II/I 比值的大小可估计自噬水平的高低。
(注意: LC3 抗体对 LC3-II 有更高的亲和力,会造成假阳性。方法
时需考虑溶酶体活性的影响。)
2 和
3 需结合使用,同
4、检测长寿蛋白的批量降解:非特异
5、 MDC ( Monodansylcadaverine ,单丹磺酰尸胺)染色:包括自噬体,所有酸性液泡都被染色,故属于非特异性的。
6、 CellTrackerTM Green 染色:主要用于双染色,但其能染所有的液泡,故也属于非特异性的。
四、自噬相关蛋白的定位
在研究自噬相关蛋白时,需对其进行定位。由于自噬体与溶酶体、线粒体、内质网、高尔基体关系密切,为了区别,常用到一些示踪蛋白在荧光显微镜下来共定位:
Lamp-2 :溶酶体膜蛋白,可用于监测自噬体与溶酶体融合。
LysoTrackerTM 探针:有红或蓝色可选,显示所有酸性液泡。
pDsRed2-mito :载体,转染后表达一个融合蛋白(红色荧光蛋白 +线粒体基质定位信号),
可用来检测线粒体被自噬掉的程度( Mitophagy )。
MitoTraker 探针:特异性显示活的线粒体,荧光在经过固定后还能保留。
Hsp60 :定位与线粒体基质,细胞死亡时不会被释放。
Calreticulin (钙网织蛋白):内质网腔
(注意:这些蛋白均为胞浆蛋白,爬片或胰酶消化的细胞在做免疫荧光前需先透膜
(permeablize ),可采用 0.1%SDS 处理。)
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