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甲基化对限制酶活性的影响 很多DNA 都含有被甲基化的碱基，下表记载了至今为止文献等报道的甲基化碱基对限制酶活性的影响及其相关的甲基化酶，以及 因甲基化而切不开的碱基序列等。 ＊1： 4m M： A or C R： A or G S： C or G C：N4-methyl cytosine 5m K： G or T Y ： C or T H： A or C or T C：C5-methyl cytosine 5hm N： A or C or G or T W ： A or T D： A or G or T C：C5-hydroxymethyl cytosine 6m A ：N6-methyl adenine ＊2 ：CG methylase 时，有时能部分切断。 ＊3： Acc I：缓慢地对Hemi-methylated GTMKA5mC 的Unmethylated strand 切出Nick。 Acc III：缓慢切断TC5mCGGA (1/75)。 Afa I：缓慢切断Hemi-methylated GTA5mC，但切不断Bi-methylated GTA5mC。 Bal I：与dcm site 相重叠的情况下 (TGGC5mCAGG)，其切断速度非常缓慢(1/50 以下)。 Bgl I：缓慢切断Hemi-methylated GC5mCN5GGC、GC4mCN5GGC、GCCN5GG5mC, 但切不断Bi-methylated M. Hae III-Bgl I site。 Cla I：缓慢切断Hemi-methylated AT5mCGAT。 EcoR I：缓慢切断Hemi-methylated GAATT5mC，切不断Bi-methylated GAATT5mC。 Fok I：缓慢切断CATC5mC (1/2~1/4)。 Hae II：非常缓慢地切断RGCG5mCY。 Hae III：在Hemi-methylated GG5mCC 的Unmethylated strand 上切出Nick。 Hind III：缓慢切断Hemi-methylated AAG5mCTT。 Hinf I ：缓慢切断GANT5mC (1/10)。 Hin1 I：非常缓慢切断GRCGY5mC。 Kpn I：有受Hemi-methylated GGTA5mCC、GGTAC5mC 影响的报道文献，缓慢切断Hemi-methylated GGTA5mC5mC。 Mbo II：有文献报道切不断Hemi-methylated T5mCTT5mC。 6m Mfl I：缓慢切断 AGATCY 。 Msp I：非常缓慢切断GGC5mCGG。 Pst I：缓慢切断Hemi-methylated 5mCTG5mCAG。 Pvu II：缓慢切断Hemi-methylated 5mCAG5mCTG。 Sal I：缓慢切断Hemi-methylated GT5mCGAC。 5m 6m Sau3A I：在Hemi-methylated GAT C 的Unmethylated strand 切出Nick。另外，也有报告说对 AGATC 的切断较慢。 Sma I：在Hemi-methylated CC5mCGGG 的Unmethylated strand 切出Nick。 Spe