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绪 论
1、重组DNA技术:是指将一种生物体(供体)的基因与载体在体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(受体)内,使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的DNA体外操作程序,也称为分子克隆技术。
因此,供体、受体、载体是重组DNA技术的三大基本元件。
4、基因工程的基本操作程序(P7)
(1).从供体生物的基因组中分离获取带目的基因的DNA片段
(2)限制性核酸内切酶将含有外源DNA和载体分子切开
(3)DNA连接酶将含有外源基因的DNA片段连接到载体分子上,形成DNA重组分子
(4)将重组DNA分子引入到受体细胞
(5)带有重组体的细胞培养拓增,获得大量的细胞繁殖群体
(6)筛选和坚定转化细胞,获得使外源基因高效稳定表达的记忆工程菌或细胞
(7)将选出的细胞克隆的目的基因进一步演剧分析,并设法使之实现功能蛋白的表达
第二章 基因工程的工具酶
一、限制性核酸内切酶P15:是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列(4—8bp),并由此处切割DNA双链的核酸内切酶
hsd R:编码限制性核酸内切酶
hsd M:编码限制性甲基化酶
hsd S:表达产物协助酶识别特殊的作用位点。
粘性末端的意义P
①连接便利
i)不同的DNA双链
只要粘性末端碱基互补就可以连接。
ii)同一个DNA分子内连接:
通过两个相同的粘性末端可以连接成环形分子。
② 5’末端标记
凸出的5’末端可用DNA多核苷酸激酶进行32P标记。
凸出的3’端可以通过末端转移酶添加几个多聚核苷酸的尾巴(如AAA或TTT等)造成人工粘性末端。
③ 补平成平齐末端
粘性末端可以用DNA聚合酶补平成平齐末端。
2、同裂酶:是不同来源分离出来的不同酶,但具有相同的识别顺序,切割DNA的方式可以相同,也可不同。如XmaI和SmaI
3、同尾酶:它们是不同的酶,但切割后可产生相同的粘性末端,因此同尾酶的切割片断之间可以相互连接,这种酶在分子生物学中有较大的价值。
4、远距离裂解酶:这类酶的识别位点与切割位点不一致,它们在某一核苷酸区域与识别顺序结合,然后滑行到识别顺序以外的另一个位点进行切割。
5、可变酶:这类酶是II型酶中的一个特例,它们的识别顺序中的1个或几个核苷酸是可变的,并且其识别顺序—般大于6个碱基对。
6、II 型限制性核酸内切酶酶解注意事项
①浓缩的酶应该用缓冲溶液稀释,稀释后应尽快用完;
②保存在50%甘油中,-20度条件下;
③ 酶切反应的时候,最后加酶;
④酶从冰箱中取出后应该放置于冰上或者冰盒上;
⑤酶应该分成小份,避免反复冻融;
⑥取酶要用新的灭菌的吸头,避免污染;
⑦加酶的体积不要超过反应体系的1/10。
影响限制性核酸内切酶活性的因素
①DNA样品的纯度
蛋白质、酚、氯仿、乙醇、EDTA、SDS等
解决方法:加大酶的用量,1 mg DNA 用 10U 酶
加大反应总体积,延长反应时间。
② DNA甲基化程度
③ 反应条件
高浓度的酶、高浓度的甘油、低离子强度、极端pH值等,会使一些核酸内切酶的识别和切割序列发生低特异性,即Star activity现象。
EcoR I在正常条件下识别并切割5‘GAATTC3’序列,但在甘油浓度超过5%,可切割5‘PuPuATPyPy3’
④酶的纯度
⑤酶切反应的温度和时间
大多数的内切酶,最适反应温度为37度,但也有例外,如Sma I 为25度。酶解时间可以通过加大酶量而缩短。
8、限制性内切酶的命名
二、DNA连接酶
1. 两种DNA连接酶
(1)大肠杆菌连接酶
需要 NAD作物辅助因子只能连接粘性末端。
T4噬菌体DNA连接酶
以ATP作为辅助因子;不但能连接粘性末端;还能连接齐平末端;RNA:DNA杂交分子中RNA上的缺口。
2. T4噬菌体RNA连接酶
以ATP作为辅助因子;催化单链DNA或RNA的
5‘-p与3’-OH共价链接
(1)连接条件
必须是两条双链DNA。
DNA3’端有游离的-OH,5’端有一个磷酸基团(P)。
需要能量
动物或噬菌体中:ATP ;大肠杆菌中:NAD+
只能连接相邻核苷酸之间的缺口
3. 影响连接反应的因素
(1)DNA末端的浓度
(2)反应温度
(3)ATP浓度
三、常用的DNA聚合酶的特点
1. 共同特点
把dNTPs连续地加到引物的3’—OH端。
2. 主要区别
持续合成能力和外切酶活性不同
3. DNA聚合酶在基因工程中的用途
大肠杆菌DNA聚合酶I
?基本性质:5’→3’的DNA聚合酶活性;5’→3’的核酸外切酶活性;3’→5’的核酸外切酶活性。
?基本用途
缺口前移标记法:Nick translation (切口平移);制备32P标记的探针。
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