基因组学复习题参考答案.doc

2006年基因组学复习题参考答案 定义题： 基因组：一个生物的全部DNA序列。 C值悖理：一般讲，C值随生物的复杂性而增加，但有时复杂性较高的生物，C值反而较低，反之亦然。这种C值与生物复杂性不一致的现象(如两栖类与哺乳动物)称为C值悖理(C-value paradox)。 单一序列：在基因组中只有一个拷贝的序列。 重复序列：在基因组中有一个以上拷贝的序列。 SINEs：short interspersed nuclear elements，核心序列281bp，单倍体核基因组中100万拷贝，约占人类基因组的12％。 LINEs：long interspersed nuclear elements， 60bp-7kb，人类基因组中有50万拷贝，占基因组的15-20％。 ORF：开放阅读框A section of a sequenced piece of DNA that begins with an initiation (methionine ATG) codon and ends with a stop codon(TAA, TAG or TGA). ORFs all have the potential to encode a protein or polypeptide, however many may not actually do so. 不对称转录：?有义链并不固定在DNA双链的某一条链上，而是在两条链上交替出现，使转录交替进行，这一现象称为不对称转录。 Gene family: 基因家族，真核生物基因组中来源相同、结构相似、功能相关的一类基因。 Gene cluster：基因簇，成簇排列在同一染色体的一组编码相同或类似蛋白质的紧密相关基因。 假基因：在多基因家族中，某些成员并不产生有功能的基因产物，但其结构和DNA序列与有功能的基因具有相似性，这些基因称为假基因。 SSR：Simple sequence repeats, 简单重复序列，也称为微卫星DNA，是散布于真核生物基因组中2－4bp的短重复序列，是分子标记的一种。 SNP：single nucleotide polymorphism，大量存在于真核生物中，分子标记的一种。 STS：sequence-tagged site，是以独特序列标记的位点，分子标记的一种。 AFLP：amplified fragment length polymorphism，分子标记的一种。 ESTs: expressed-sequence tags，由cDNA经部分测序而来。 Haplotype：单倍型，指一条染色体是的基因型。 连锁图谱：以位点间重组率为基础而得到的遗传图谱，图距单位为M或cM。 物理图谱：以绝对距离为基础而构建的遗传图谱，图距单位以bp、kb和mb表示。 重叠群：能够覆盖整个染色体或基因组、末端序列相互重叠的DNA片段。 二、填空题： 基因可以根据最终产物或产物功能进行分类。 含有内含子的基因称为断裂基因。 真核生物的核DNA序列可以根据其功能而划分为：有功能序列、无功能序列和功能未知序列。可以根据其拷贝数划分为：单拷贝序列和重复序列，后者又可进一步划分为低度重复序列、中度重复序列和高度重复序列。 真核生物核DNA中的重复序列，可以根据其重复方式简单地划分为串联重复序列和散布重复序列。 严格讲，真核生物基因组是指单倍体细胞核和细胞质DNA的总和。 一般讲的基因组大小，是指生物单倍体细胞核基因组总DNA含量。 基因组大小的度量方式有2种，分别以碱基对数和质量为度量单位。 Haldane和Cosambi构图函数的主要区别是前者没有考虑了干扰。 三、判断题(判断下列叙述是否正确，正确的在括弧中打“?”，错误的在括弧中打“?”) 真核生物与原核生物基因结构的主要区别是前者含有大量的内含子。(?) 间隔（spacer）DNA只起连接基因的作用，根本没有其他功能。(?) 基因组中不进行转录的序列是无功能序列。（?） 虽然原核生物与真核生物基因组的大小差异悬殊，但它们的基因含量差别不大。(?) 真核生物基因组中，虽然无功能序列本身不进行转录而形成有功能的产物，但它们可以通过转座和不对等交换等机制，而影响功能基因。（?） 1C=一个生物单倍体核基因组总DNA的质量，C值大小反应了一个生物的进化程度。所以，可以根据C值比较生物的进化程度。(?) 连锁图上位点间的距离不是以任何物理单位来度量的，它反应的只是两个位点间的重组频率，交换并非随机分布，在交换集中或受抑制的区域，遗传图距与物理距离是不同的。(?) 人类基因组计划在完成全序列测定后，主要的工作集中在基因及其功能的预测上。(?) 在物理图谱中，按照它们的分辨率，自低致高依次是连锁图谱、染色体图谱、RH图谱和DNA序列图谱。