水牛瘤胃菌群环境关联性、季节波动性和木质纤维素降解能力的研究.pdfVIP

水牛瘤胃菌群环境关联性、季节波动性和木质纤维素降解能力的研究 目录 摘要i Abstract iii 缩略语表 （Abbreviation ）vi 第一章 前言 1 1 文献综述 1 1.1 瘤胃微生物的影响因素及与环境微生物的关系 1 1.2 微生物对木质纤维素的降解作用4 2 目的与意义7 第二章 水牛瘤胃菌群的波动性及环境关联性 8 1 前言 8 2 材料与方法9 2.1 实验动物与样品来源9 2.2 主要试剂和仪器设备 10 2.3 试验方法 10 3 结果与分析 17 3.1 总体样本测序数据评估 17 3.2 不同季节水牛瘤胃菌群多样性比较 19 3.3 饲喂周期内不同采样时间瘤胃菌群多样性比较25 3.4 瘤胃与各类环境样本菌群相似性比较30 4 讨论36 4.1 不同季节间瘤胃菌群多样性变化36 4.2 饲喂周期内不同时间瘤胃菌群多样性变化37 4.3 瘤胃菌群与环境微生物的关联性分析38 5 小结39 第三章 水牛瘤胃菌群功能分析及木质纤维素降解能力研究40 1 前言40 2 材料与方法41 I 华中农业大学2020 届硕士研究生学位（毕业）论文 2.1 实验动物41 2.2 主要试剂和仪器设备41 2.3 主要试剂的配制42 2.4 培养基配制45 2.5 试验方法46 3 结果与分析 61 3.1 杂交水牛瘤胃微生物多样性与功能分析61 3.2 瘤胃源降解木质素微生物的筛选结果67 3.3 分离菌株的物种鉴定68 3.4 分离菌株与环境微生物的溯源分析71 3.5 试验菌株的确定72 3.6 菌株B58 的生物学特性75 3.7 菌株B58 的木质纤维素降解能力77 3.8 菌株B58 产木质纤维素降解酶的能力 80 3.9 菌株B58 的益生潜力 81 3.10 菌株B58 的抗逆性 84 4 讨论 86 4.1 降解木质素微生物的筛选方法 86 4.2 瘤胃中降解木质纤维素的微生物 87 4.3 芽孢杆菌对木质素的降解能力 88 4.4 芽孢杆菌产降解木质纤维素相关酶的能力 89 4.5 芽孢杆菌的益生潜力评估90 5 小结92 第四章 结论与创新93 1 结论93 2 不足93 3 创新点94 参考文献95 附录 107 II 水牛瘤胃菌群环境关联性、季节波动性和木质纤维素降解能力的研究 附录I 样本DNA 提取质量检测 107 附录II 菌株种属鉴定及同源性比较 111 致谢 119 III 水牛瘤胃菌群