PLAG1基因多态性与中国黄牛体尺性状的相关性研究.pdfVIP

摘 要 摘 要 多形性腺瘤基因1 （Pleomorphic adenoma gene 1, PLAG1 ）可通过增强胰岛素样生 长因子2 （Insulin-like growth factor 2, IGF2 ）等生长因子的表达能力，调控动物的生长 和发育。此前，有研究证明PLAG1 的SNP （AC_000171.1:gT, rs109815800 ） 与欧洲牛的体型大小显著相关，Indel （AC_000171.125020872 rs523753416 ） 与中国黄牛4 个品种的体尺性状显著相关，但这2 个位点多态性在中国黄牛中的分布 情况尚不清楚。 为探索PLAG1 的SNP （rs109815800 ）和Indel （rs523753416 ）2 个位点与中国黄 牛体尺性状的相关性，本研究针对这2 个位点设计特异性引物，利用PCR 扩增、测序 技术、聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和统计学原理，验证这 2 个位点的多态性，并分析其 与中国黄牛体尺性状的相关性。针对rs109815800 位点，采集558 头来自7 个黄牛品种 的成年母牛，验证该位点多态性与黄牛体尺性状的相关性，随后利用38 个中国黄牛品 种共计 1,102 个个体分析该位点多态性在中国黄牛品种中的分布情况；针对 rs523753416 位点，采集451 头雌性成年云岭牛，验证该位点多态性与黄牛体尺性状的 相关性，随后利用35 个中国黄牛品种共计 1,306 个个体分析该位点多态性在中国黄牛 品种中的分布情况。获得如下结果： （1）在黄牛PLAG1 的rs109815800 位置检测到一个GT 的突变，即检测到G（Q ） 和T （q ）两种等位基因，QQ、Qq 和qq 三种基因型。该位点多态性与黄牛的体高、十 字部高、体斜长和胸围4 个体尺性状显著相关：携带 QQ 基因型的黄牛的体高和体斜 长显著大于携带 Qq 基因型的黄牛（P0.05 ）；携带 QQ 基因型和 Qq 基因型的黄牛与 携带qq 基因型的黄牛相比，体高、十字部高、体斜长和胸围差异极显著 （P0.01 ）。在 中国本地黄牛品种中，rs109815800 位点多态性呈现明显的地理分布规律：Q 等位基因 频率由北向南呈减少趋势，q 等位基因则相反；2 个专门化肉牛品种中Q 等位基因的频 率显著高于中国本地黄牛的平均值。 （2 ）在黄牛PLAG1 的rs523753416 位置检测到19 bp 的Indel ，即检测到W （366 bp ）和D （347 bp ）两种等位基因，WW、WD 和DD 三种基因型。rs523753416 的位点 多态性与云岭牛的3 个体尺性状显著相关：携带 WD 基因型的云岭牛的体高和十字部 高显著高于携带WW 基因型和DD 基因型的个体（P0.05 ），携带WW 基因型和 WD 基 因型的个体的胸围显著大于携带DD 基因型的个体（P0.05 ）。在中国本地黄牛品种中， rs523753416 位点多态性在北方黄牛和中原黄牛中呈现明显的地理分布规律：随着纬度 的增加，W 等位基因频率逐渐增加，D 等位基因则相反。 综上所述，PLAG1 的SNP （rs109815800 ）与家养黄牛的体高、十字部高、体斜长 I 西北农林科技大学硕士学位论文 和胸围4 个体尺性状显著相关，Indel （rs523753416 ）与家养黄牛的体高、十字部高和 胸围 3 个体尺性状显著相关。它们的位点多态性在中国黄牛品种中的分布情况具有一 定的地理分布规律，因此rs109815800 和rs523753416 可作为黄牛体尺性状选育的候选 分子标记。 关键词：中国黄牛；PLAG1 ；SNP；Indel ；体尺性状；相关性 II 目 录 目