系统进化树制作步骤mega5.10.docx

系统进化树制作步骤 MEGA5.1 先要把格式弄成该软件识别的 meg格式，fasta格式也行，只要能够导入 1导入，点击左上角 Align，选择创建新的比对 Alignment，点击 OK， 5?.LQ (5121019) I tile s H*lp Aign Dd [Modeh Distaruce D 畝iHy Fh^ger ■J w ■ J w FHtlmUw? TiJoiid Ewamp les C^kxi Rspoil a B MEGA ida*se：#5121(119 2提示创建DNA分析文件，进入如下右边界面 □ M ?0扁 □ M ?0扁 OFIA | Tr吉n却皈石 PrMeri ￡旳u恵n唆 | D “ R 韩W D “ R 韩 W够 ■ 1 |1 AlLDw*?nt Rtb Seoneac-H- Dirplir IL ￡ceci-e a ■■ Afcbf.- .1. ell Z-IB2 4E-EE-. 113- =s-zi ce-- 1 p^-llh^iSrlJi q?na 3. ijll W34SE-EE . 113- z=Tl CF-r 1 r^lvh*i3rUi 口?n? ZaivAn 事?-alIHlf 113 ?l l?? kcL CF，r ? 匸；:■右y q*?n* 5. c-LIA3aO33€l .113. CFJ ￡班 ioz p^l7^.*dxix 二■口■口 雷?311097770.1 IB, WL CPV 1 RK銘学001 皿日工电冃?匕匕心￡白 .112. earl CFV 二 FKA :cz pcl7H?dZ-n ■石豊■二口 a ci jj^ocsa；€a. i is. cfj ^ka faf 芦却：lt-占上丄克：*?=鼻內 3. ffllZJ!. 112. nori CFV 二 KKa faz pDL7h.?dizn sr 工■■二口 10- jl . 113 . 乂沁 CFir 1 詁口 p=l^?drlK al±Ji*.r XL. 711 kY 01E S . 1 SisnSz-nlxn.us fuzict**z-^9 LFJ 1 Kimizi sub -2 ? jl |kV504c~E . 1 CdrteXAt.Dfl IB 1 1LE Hdmn ：?. ji 1 -*1^ $$ . 1 *er.dr-ulir口a： OFF 丄 rlQ4 3打开fasta格式的序列文件，如下 EHBcnt Erplorcr tcpv-1? fa^t a) DMA.Se-qojanc?5 | Translaled Protein Sequences | 4选择Alignment中的比对选项，使用 Clastaw比对，会有比对参数，默认即可，点 OK，会 自行完成比对。 5比对好的文件须保存，选 Data中的save session提示保存命名 .，X 古1* 囲?在 d- | ^?rialF （f：） tjiciens _!和情 j tCrTBfcMKH UiJ OMBKWT JIisL.1 j Lwavu F申$r ? ril4A ir-a^s-ix faa*! h J |AJb 54I934A. ~3 IW^S1）. 6到MEGA主界面，点击 data ，打开刚才保存的文件，会有如下提示，选 An alyze 即导入数据如右。 D和 D和e阳甲 Pf^ilQg 沖 Uw Tree 7选中带有TA的方框，如上图, 进化树类型，一般用 NJ树。 点击主界面上的进化树选项，如下图中间，可选择不同的 10*4 一 -—1X1悴一 一 S-BLS m-s?3 TIa*-B5 ? ￡?□ Db se??HLl.nalrkrl*- ml — fz■■勺■】T?-IL THI.C-C n^i 召 p-hf -ipSLilgkIlM 占 ^■■rnzllTF ■雷■! ,m Bti ll^?r-J3.ULE i?￡巨-1|-?牛 FL i i