实验动物肝脏DNA提取.pptVIP

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8.凝胶板的制备: (1)取琼脂糖0.7 g,加1×TBE缓冲溶液100ml,于沸水浴中至熔化,制成0.7%的琼脂糖胶液。 (2)胶床两头贴上防水胶带,形成8mm高的挡墙,压紧胶带,置水平台面上。 (3)插入梳子,梳齿下端离板底0.5-1mm。 (4)在胶床上滴加2-3滴 0.5μg/mL的EB溶液。 (5)将60℃凝胶不间断倒入胶床,高3-4mm,避免气泡,摇匀,室温下凝固。 (6)完全凝固后,撕掉胶带,置于电泳槽中,加入电泳缓冲液,高于胶面1-2mm,从一头轻轻斜拉出梳子,除去产生的气泡。 9.加样: 将样品DNA溶液与加样缓冲液以5 :1的体积比混合,用微量移液器加样,每加完一个样品,冲洗三次。加样量15~20 ?l (加样时应防止碰坏样品孔周围的凝胶面以及穿透凝胶底部)。 10.电泳: 为了获得电泳分离DNA片段的最大分辨率,电场强度不应高于5V/cm(两电极间的距离)开始时用较高电压(80V),样品一进入胶内则将电压调至5V/cm 。当染料前沿移至底边1-2mm时,电泳毕。 11. 观察 关闭电源,取出胶床,在紫外检测仪下观察凝胶中的DNA(红橙色荧光)。 五、思考题: 1、用荧光染料EB染色的原理和优缺点是什么? 2、绘制DNA电泳图谱。 核酸提取过程中的注意事项: (1)避免过酸过碱或高温环境,合适的T:0-4℃, pH4-9; (2)防止机械力的切割作用,避免剧烈振荡; (3)防止核酸酶的降解作用,可加入抑制剂-EDTA,柠檬酸钠; (4)整个操作步骤应尽量简化,缩短实验过程,减少核酸变性、降解、机械切割的机会。 实验 动物肝脏DNA提取 二、实验原理: 要获得纯的DNA样品,必须考虑以下几点: 如何选材,如何破碎组织细胞? 如何除去蛋白质?(在真核细胞内,DNA与蛋白质结合成核蛋白的形式存在。因此,分离DNA时必须使其与蛋白质解离,并除去蛋白质。) 设法除去RNA的污染; 防止DNA酶的降解作用; (一)动物肝脏DNA制备原理 选 材 要提取动物组织DNA,一般选择细胞膜较脆弱,容易破碎的动物脏器,如胸腺、肝脏、脾脏、胰脏等。 研磨:将剪碎的动物组织置于研钵或匀浆器中,加入少量石英砂研磨或匀浆,破碎细胞。这种方法温和,适合实验室使用。 组织捣碎器:较剧烈的破碎细胞的方法,为了防止发热和升温过高,通常是转10秒—20秒,停10秒—20秒,可反复多次。 压榨法:在1000×105Pa—2000×105Pa 的高压下使几十毫升的细胞悬液通过一个小孔突然释放至常压,细胞将彻底破碎。温和的、彻底破碎细胞的方法,但仪器费用较高。 细胞破碎方法—机械物理法: 反复冻融法:将待破碎的细胞冷至-15℃到-20℃,然后放于室温(或40℃)迅速融化,由于细胞内形成冰粒使剩余胞液的盐浓度增高而引起细胞溶胀破碎。 超声波处理法:借助超声波的振动力破碎细胞壁和细胞器。使用时注意降温,防止过热。 冷热交替法:在90℃左右维持数分钟,立即放入冰浴中使之冷却,如此反复多次,绝大部分细胞可以被破碎。 细胞破碎方法—机械物理法 细胞破碎方法—化学方法 有机溶剂处理法:利用氯仿、甲苯等脂溶性溶剂或SDS(十二烷基硫酸钠)等表面活性剂处理细胞,可将细胞膜溶解,从而使细胞破裂,此法也可以与研磨法联合使用。 溶胀法:细胞膜为天然的半透膜,在低渗溶液和低浓度的稀盐溶液中,由于存在渗透压差,溶剂分子大量进入细胞,将细胞膜胀破释放出细胞内含物。 (三)除去RNA的方法 脱氧核糖核蛋白在浓NaCl(1-2mol/L)溶液中溶解度很大,但在0.14mol/L NaCl溶液中溶解度很低,而核糖核蛋白则溶于0.14mol/L NaCl溶液中,利用这一性质可将脱氧核糖核蛋白与绝大部分核糖核蛋白分离开来。 (四)除去蛋白质的方法 用氯仿一异戊醇混合液振荡核蛋白溶液,使蛋白质变性,然后离心除去变性蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA溶于上层水相。用两倍体积 95%乙醇溶液可将DNA钠盐沉淀出来。 用十二烷基硫酸钠(SDS)等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA。 纯的DNA样品的获得 为了防止DNA酶的降解,提取时可加入适量EDTA(乙二胺四乙酸)、柠檬酸,以降低DNA酶的活性。 加入RNA酶降解剩余的RNA,获得纯的DNA。 保存:将DNA于滤纸上干燥,溶于1mlTE中低温保存。   (二)琼脂糖凝胶电泳分离核酸的原理: 琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖凝胶作为支持介质的一种电泳分离方法,是一种简便、快速分离鉴定核酸的方法,已成为分子生物学及基因工程研究中常用实验方法之一。 琼脂糖英文名agarose,是从琼脂中提取出来的,由半乳糖和3.6-脱

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