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An Introduction to GenomeInfoDb Martin Morgan, Hervé Pagès, Marc lson, Sonali Arora Modified: 17 January, 2014. Compiled: March 27, 2020 Contents 1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 2 Functionality for all existing organisms . . . . . . . . . . . . . . . 2 2.1 genomeStyles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 2.2 extractSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2.3 extractSeqlevelsByGroup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2.4 seqlevelsStyle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2.5 seqlevelsInGroup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 2.6 orderSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 2.7 rankSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 2.8 mapSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 2.9 renameSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 2.10 dropSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 2.11 keepSeqlevels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 2.12