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vasp 的分子动力学模拟
VASP 2010-01-15 02:26:36 阅读 57 评论 0 字号: 大中 小
vasp 做分子动力学的好处,由于 vasp 是近些年开发的比较成熟的软件,在做电子 scf 速度
方面有较好的优势。
缺点:可选系综太少。
尽管如此,对于大多数有关分子动力学的任务还是可以胜任的。
主要使用的系综是 NVT 和 NVE 。
下面我将对主要参数进行介绍!
一般做分子动力学的时候都需要较多原子,一般都超过 100 个。
当原子数多的时候, k 点实际就需要较少了。有的时候用一个 k 点就行,不过这都需要严格
的测试。通常超过 200 个原子的时候,用一个 k 点,即 Gamma 点就可以了。
INCAR :
EDIFF 一般来说,用 1E-4 或者 1E-5 都可以,这个参数只是对第一个离子步的自洽影响
大一些,对于长时间的分子动力学的模拟,精度小一点也无所谓,但不能太小。
IBRION=0 分子动力学模拟
IALGO=48 一般用 48 ,对于原子数较多,这个优化方式较好。
NSW=1000 多少个时间步长。
POTIM=3 时间步长 ,单位 fs, 通常 1 到 3.
ISIF=2 计算外界的压力 .
NBLOCK= 1 多少个时间步长,写一次 CONTCAR ,CHG 和 CHGCAR ,PCDAT.
KBLOCK=50 NBLOCK*KBLOCK 个步长写一次 XDATCAR.
ISMEAR=-1 费米迪拉克分布 .
SIGMA =0.05 单位 :电子伏
NELMIN=8 一般用 6 到 8, 最小的电子 scf 数 .太少的话 ,收敛的不好 .
LREAL=A
APACO=10 径向分布函数距离 , 单位是埃 .
NPACO=200 径向分布函数插的点数 .
LCHARG=F 尽量不写电荷密度 ,否则 CHG 文件太大 .
TEBEG=300 初始温度 .
TEEND=300 终态温度。 不设的话,等于 TEBEG.
SMASS -3 NVE ensemble;-1 用来做模拟退火。大于 0 NVT 系综。
【转】vasp 的分子动力学模拟
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小木虫 (金币 +1 ): 奖励一下,谢谢提供资源
uuv2010( 金币 +1): 您是否可以做一个专题,详细讲讲怎么做?比如第一步需要干什么,第二步
需要干什么,结果怎么分析 ……如果能做一个这样完整的专题就太好了,不知道您是否有兴趣?
2011-07-13 18:20:12
uuv2010( 金币 +1): 多谢提供资源 2011-07-16 17:39:55
uuv2010( 金币 +5, 1ST 强帖 +1): 多谢您的详细讲解!感谢就此专题与大家分享! 2011-08-12
18:25:12
vasp 做分子动力学的好处,由于 vasp 是近些年开发的比较成熟的软件,在做电子 scf 速度
方面有较好的优势。
缺点:可选系综太少。
尽管如此,对于大多数有关分子动力学的任务还是可以胜任的。
主要使用的系综是 NVT 和 NVE 。
下面我将对主要参数进行介绍!
一般做分子动力学的时候都需要较多原子,一般都超过 100 个。
当原子数多的时候, k 点实际就需要较少了。有的时候用一个 k 点就行,不过这都需要严格
的测试。通常超过 200 个原子的时候,用一个 k 点,即 Gamma 点就可以了。
INCAR :
EDIFF 一般来说,用 1E-4 或者 1E-5 都可以,这个参数只是对第一个离子步的自洽影响
大一些,对于长时间的分子动力学的模拟,精度小一点也无所谓,但不能太小。
IBRION=0 分子
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